read.table 有 "right-aligned" 数据
read.table with "right-aligned" data
我有一个文本文件要在 R 中读取,但该文件似乎不是制表符分隔的。该文件的唯一结构是列总是在某个点结束(即列右对齐)。
那么,首先,这种数据结构有名称吗?那么,如何在R中读取呢?
2.37 2.03 2.38
5,397 5,082 5,609
13.0 21.6 15.2 15.2
128.0 103.1 134.2 133.4
仅使用 read.table() 是行不通的,缺失值不会放在正确的位置...
# download data:
tmp <- tempfile()
f <- download.file("http://usda.mannlib.cornell.edu/usda/waob/wasde//1990s/1995/wasde-01-12-1995.txt", tmp)
D <- file(tmp)
data_enc <- readLines(D, warn=FALSE)
close(D)
dat <- sapply(strsplit(data_enc[232:236], ":"), function(x) x[2])
writeLines(dat, tmp)
## try to read data:
read.table(tmp, fill = TRUE, sep ="", header=FALSE)
给出:
V1 V2 V3 V4
1 2.37 2.03 2.38 NA
2 5,397 5,082 5,609 NA
3 13.0 21.6 15.2 15.2
也许尝试使用 read.fwf
读取 table 固定宽度格式的数据:
widths <- gregexpr("\.\d", readLines(tmp)[5])[[1]]+1L # line 5 looks complete
widths <- c(widths[1], diff(widths)) # posis after the decimal points as widths
read.fwf(tmp, widths = widths)
# V1 V2 V3 V4
# 1 2.37 2.03 NA 2.38
# 2 5,397 5,082 NA 5,609
# 3 13.0 21.6 15.2 15.2
# 4 128.0 103.1 134.2 133.4
# 5 146.4 130.9 156.5 155.7
我有一个文本文件要在 R 中读取,但该文件似乎不是制表符分隔的。该文件的唯一结构是列总是在某个点结束(即列右对齐)。
那么,首先,这种数据结构有名称吗?那么,如何在R中读取呢?
2.37 2.03 2.38
5,397 5,082 5,609
13.0 21.6 15.2 15.2
128.0 103.1 134.2 133.4
仅使用 read.table() 是行不通的,缺失值不会放在正确的位置...
# download data:
tmp <- tempfile()
f <- download.file("http://usda.mannlib.cornell.edu/usda/waob/wasde//1990s/1995/wasde-01-12-1995.txt", tmp)
D <- file(tmp)
data_enc <- readLines(D, warn=FALSE)
close(D)
dat <- sapply(strsplit(data_enc[232:236], ":"), function(x) x[2])
writeLines(dat, tmp)
## try to read data:
read.table(tmp, fill = TRUE, sep ="", header=FALSE)
给出:
V1 V2 V3 V4
1 2.37 2.03 2.38 NA
2 5,397 5,082 5,609 NA
3 13.0 21.6 15.2 15.2
也许尝试使用 read.fwf
读取 table 固定宽度格式的数据:
widths <- gregexpr("\.\d", readLines(tmp)[5])[[1]]+1L # line 5 looks complete
widths <- c(widths[1], diff(widths)) # posis after the decimal points as widths
read.fwf(tmp, widths = widths)
# V1 V2 V3 V4
# 1 2.37 2.03 NA 2.38
# 2 5,397 5,082 NA 5,609
# 3 13.0 21.6 15.2 15.2
# 4 128.0 103.1 134.2 133.4
# 5 146.4 130.9 156.5 155.7