绘制具有 fixed-positioned 条边的图形

Question

我正在尝试将 NetworkX 用于 Python，到目前为止它还不错，但我受困于绘图。

我的数据其实是一个城市十字路口的列表。节点是 X、Y（纬度、经度）的十字路口，边缘应该是道路。到目前为止很简单。

所以我设法用固定位置画出了我的小城市：

    G = nx.Graph()
    for node in nodes:
      attributes = dict(node.items())
      G.add_node(attributes.pop('id'))
      G.node[node.get('id')]['pos'] = attributes.values()

    pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
    nx.draw(G,pos)
    plt.show()

看起来像这样：

完全像我想要的那样，但我需要添加边缘。所以如果我像这样添加它们：

    G = nx.Graph()
    for node in nodes:
      attributes = dict(node.items())
      G.add_node(attributes.pop('id'))
      G.node[node.get('id')]['pos'] = attributes.values()

    for link in links:
      attributes = dict(link.items())
      G.add_edge(attributes.pop('from'), attributes.pop('to'))

    pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
    nx.draw(G,pos)
    plt.show()

我收到这个可怕的错误：

Traceback (most recent call last):
   File "ms/Main.py", line 28, in <module>
 nx.draw(G,pos)
   File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 131, in draw
 draw_networkx(G, pos=pos, ax=ax, **kwds)
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 265, in draw_networkx
 edge_collection = draw_networkx_edges(G, pos, **kwds)
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 610, in draw_networkx_edges
 minx = numpy.amin(numpy.ravel(edge_pos[:, :, 0]))
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/fromnumeric.py", line 2216, in amin
 out=out, keepdims=keepdims)
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/_methods.py", line 29, in _amin
 return umr_minimum(a, axis, None, out, keepdims)
 TypeError: cannot perform reduce with flexible type

如果我不设置固定位置我可以画出来没问题，但我非常需要边缘是静态的。有什么建议吗？非常感谢！

Answer 1

X、Y 数据未被视为数字。

你可以用这个修复它：

 xy = attributes.values()
 G.add_node(attributes.pop('id'), dict([('pos', (float(xy[0]),float(xy[1])) )]))

注意：此答案已被 OP 编辑到问题中。我已将其移至此处的答案部分并将其设为社区 Wiki，因此我不会因此获得任何代表。

绘制具有 fixed-positioned 条边的图形

Draw graph with fixed-positioned edges

python

graph

graph-drawing

networkx

python-2.7