ggtern 禁用了 ggplot2 的一些主题
ggtern disables some themes from ggplot2
尝试将主题切换为 theme_bw()
无效,theme_grey()
似乎优先。有什么想法吗?
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
编辑:
正如评论中所建议的,这在 运行 干净的 R 会话中有效。但是当我在加载了 ggtern
的会话中实现代码时,问题就出现了。
library(ggplot2)
#Warning message:
#package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.5
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
# sessionInfo()
# R version 3.2.2 (2015-08-14)
# Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
# Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
#
# locale:
# [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
# [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
# [5] LC_TIME=English_United States.1252
#
# attached base packages:
# [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
#
# other attached packages:
# [1] ggplot2_2.1.0
#
# loaded via a namespace (and not attached):
# [1] labeling_0.3 colorspace_1.2-6 scales_0.4.0 plyr_1.8.3 tools_3.2.2 gtable_0.1.2
# [7] Rcpp_0.12.2 grid_3.2.2 munsell_0.4.2
library(ggtern)
#Loading required package: ggplot2
#Attaching package: ‘ggtern’
#The following objects are masked from ‘package:ggplot2’:
#aes, calc_element, ggplot, ggplot_build, ggplot_gtable, ggplotGrob, ggsave, is.ggplot, layer_data,
#layer_grob, layer_scales, theme, theme_bw, theme_classic, theme_dark, theme_get, theme_gray,
#theme_light, theme_linedraw, theme_minimal, theme_set, theme_void
#Warning messages:
#1: package ‘ggtern’ was built under R version 3.2.5
#2: package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.5
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
# sessionInfo()
# R version 3.2.2 (2015-08-14)
# Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
# Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
#
# locale:
# [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
# [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
# [5] LC_TIME=English_United States.1252
#
# attached base packages:
# [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
#
# other attached packages:
# [1] ggtern_2.1.1 ggplot2_2.1.0
#
# loaded via a namespace (and not attached):
# [1] Rcpp_0.12.2 lattice_0.20-33 MASS_7.3-45 grid_3.2.2 plyr_1.8.3
# [6] bayesm_3.0-2 gtable_0.1.2 magrittr_1.5 scales_0.4.0 stringi_1.0-1
# [11] compositions_1.40-1 robustbase_0.92-5 latex2exp_0.4.0 boot_1.3-17 labeling_0.3
# [16] proto_0.3-10 tools_3.2.2 stringr_1.0.0 energy_1.6.2 DEoptimR_1.0-4
# [21] munsell_0.4.2 colorspace_1.2-6 tensorA_0.36 gridExtra_2.0.0
看起来 ggtern 掩盖了 ggplot2 的很多主题。
我通过分离 ggtern 解决了我的问题。
detach("package:ggtern",unload=T)
ggtern
掩码 theme_bw()
,这意味着 ggtern
有自己的 theme_bw()
版本,它覆盖了 ggplot2
版本。奇怪的是,ggtern
的 theme_bw()
版本看起来像 theme_grey()
,所以这可能是一个错误。
如果您想保持 ggtern
加载,另一种选择是强制执行 theme_bw()
的 ggplot2
版本:
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + ggplot2::theme_bw()
不幸的是,您不能在加载 ggtern
之后只加载 ggplot2
(以避免屏蔽问题),因为 ggtern
加载 ggplot2
。
要查看 theme_bw()
每个版本的代码差异,请在控制台中键入以下内容:
ggplot2::theme_bw
ggtern::theme_bw
更新: ggplot2
和 ggtern
中的上述主题冲突发生在 ggtern
版本 2.1.2 和更早版本中,但是2.1.3版本不再出现冲突,所以你需要做的就是更新到最新版本ggtern
。有关详细信息,请参阅@NicolasHamilton 的回答。
ggtern
掩码 EVERY 来自 ggplot2 的默认主题,这是因为在编写此软件时,已经创建了约 60 个新主题元素,这些元素按顺序存在使 ggtern
正确呈现。如需新主题元素的完整列表,运行以下命令:
library(ggtern)
?theme_elements
综上所述,正如您所指出的那样,由于 ggtern
还修改了一些基本主题元素,并且从大约版本 2.1.2 - 2.1.3
开始,我发现了一些冲突完全 re-worked 主题,以便 ggtern
不再修改任何基本元素 -- 希望这种烦人的行为现在已经永远消失了!
我正在制作关于这个包的出版物,并且已经提炼了很多很多long-tern烦恼,所以请从我的网站下载并安装最新版本(2.1.4
) (Bitbucket Repository)。令人尴尬的是,即使是 CRAN 上的最后一个 2.1.3
版本,当 运行 在 grid.arrange
类型的情况下绘制两个图时,我也发现了一个非常重要的错误。这是剪贴蒙版的问题,已经解决 in 2.1.4
尚未发送到 CRAN,我计划立即进行。
无论如何,为了回答你的问题,请升级你的版本,你是 运行ning 版本 2.1.0
,这是在 ggplot2
中进行巨大修改后不久发布的版本 - - 事实上,就在不久之前,之前的版本被严重破坏,几乎需要 ggtern
的整个 re-writing,所以拥有完美的主题是我最不优先考虑的事情。在最近的版本中,由于我有时间细化和识别问题,这种行为应该已经得到解决——由以下两 (2) 个命令 运行 证明(按此顺序,来自干净的 session ),除了标题明显不同外,应该会产生相同的结果:
library(ggplot2)
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) +
geom_point() + theme_bw() +
labs(title='From ggplot2')
library(ggtern)
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) +
geom_point() + theme_bw() +
labs(title='From ggtern')
如果我只能说,这可能看起来有点 off-topic,但整个问题实际上最初源于一件事,通过几度的分离。 ggplot2
的设计没有剪贴蒙版,它使用网格视口作为一个伪剪贴蒙版,因为它的所有绘图(极坐标变换除外)都在矩形区域上渲染。位于矩形区域之外的数据映射随后被视口丢弃。 ggtern
另一方面需要一个,因为它需要在位于 矩形 视口中的 三角形 形状的多边形区域中渲染 --众所周知,'三角形不适合方孔' 或者俗话说!当轴限制减少时,数据映射可以并且经常位于三角形区域之外,这些需要删除或屏蔽(或者如果用户愿意则显示)。删除不是一种选择,因为它会影响某些图,如多边形图、路径图、密度图或等高线图(我认为点几何可能是唯一不受潜在影响的几何图),这只剩下一个选项——剪贴蒙版的实现.在某些较早的版本中,未实现剪贴蒙版(有利于对数据进行子集化),因此需要修改基本主题元素。如果有的话,也许是最初的 'poor design',在许多代之后流传到令人沮丧的行为。
尝试将主题切换为 theme_bw()
无效,theme_grey()
似乎优先。有什么想法吗?
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
编辑:
正如评论中所建议的,这在 运行 干净的 R 会话中有效。但是当我在加载了 ggtern
的会话中实现代码时,问题就出现了。
library(ggplot2)
#Warning message:
#package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.5
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
# sessionInfo()
# R version 3.2.2 (2015-08-14)
# Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
# Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
#
# locale:
# [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
# [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
# [5] LC_TIME=English_United States.1252
#
# attached base packages:
# [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
#
# other attached packages:
# [1] ggplot2_2.1.0
#
# loaded via a namespace (and not attached):
# [1] labeling_0.3 colorspace_1.2-6 scales_0.4.0 plyr_1.8.3 tools_3.2.2 gtable_0.1.2
# [7] Rcpp_0.12.2 grid_3.2.2 munsell_0.4.2
library(ggtern)
#Loading required package: ggplot2
#Attaching package: ‘ggtern’
#The following objects are masked from ‘package:ggplot2’:
#aes, calc_element, ggplot, ggplot_build, ggplot_gtable, ggplotGrob, ggsave, is.ggplot, layer_data,
#layer_grob, layer_scales, theme, theme_bw, theme_classic, theme_dark, theme_get, theme_gray,
#theme_light, theme_linedraw, theme_minimal, theme_set, theme_void
#Warning messages:
#1: package ‘ggtern’ was built under R version 3.2.5
#2: package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.5
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + theme_bw()
# sessionInfo()
# R version 3.2.2 (2015-08-14)
# Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
# Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
#
# locale:
# [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
# [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
# [5] LC_TIME=English_United States.1252
#
# attached base packages:
# [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
#
# other attached packages:
# [1] ggtern_2.1.1 ggplot2_2.1.0
#
# loaded via a namespace (and not attached):
# [1] Rcpp_0.12.2 lattice_0.20-33 MASS_7.3-45 grid_3.2.2 plyr_1.8.3
# [6] bayesm_3.0-2 gtable_0.1.2 magrittr_1.5 scales_0.4.0 stringi_1.0-1
# [11] compositions_1.40-1 robustbase_0.92-5 latex2exp_0.4.0 boot_1.3-17 labeling_0.3
# [16] proto_0.3-10 tools_3.2.2 stringr_1.0.0 energy_1.6.2 DEoptimR_1.0-4
# [21] munsell_0.4.2 colorspace_1.2-6 tensorA_0.36 gridExtra_2.0.0
看起来 ggtern 掩盖了 ggplot2 的很多主题。
我通过分离 ggtern 解决了我的问题。
detach("package:ggtern",unload=T)
ggtern
掩码 theme_bw()
,这意味着 ggtern
有自己的 theme_bw()
版本,它覆盖了 ggplot2
版本。奇怪的是,ggtern
的 theme_bw()
版本看起来像 theme_grey()
,所以这可能是一个错误。
如果您想保持 ggtern
加载,另一种选择是强制执行 theme_bw()
的 ggplot2
版本:
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) + geom_point() + ggplot2::theme_bw()
不幸的是,您不能在加载 ggtern
之后只加载 ggplot2
(以避免屏蔽问题),因为 ggtern
加载 ggplot2
。
要查看 theme_bw()
每个版本的代码差异,请在控制台中键入以下内容:
ggplot2::theme_bw
ggtern::theme_bw
更新: ggplot2
和 ggtern
中的上述主题冲突发生在 ggtern
版本 2.1.2 和更早版本中,但是2.1.3版本不再出现冲突,所以你需要做的就是更新到最新版本ggtern
。有关详细信息,请参阅@NicolasHamilton 的回答。
ggtern
掩码 EVERY 来自 ggplot2 的默认主题,这是因为在编写此软件时,已经创建了约 60 个新主题元素,这些元素按顺序存在使 ggtern
正确呈现。如需新主题元素的完整列表,运行以下命令:
library(ggtern)
?theme_elements
综上所述,正如您所指出的那样,由于 ggtern
还修改了一些基本主题元素,并且从大约版本 2.1.2 - 2.1.3
开始,我发现了一些冲突完全 re-worked 主题,以便 ggtern
不再修改任何基本元素 -- 希望这种烦人的行为现在已经永远消失了!
我正在制作关于这个包的出版物,并且已经提炼了很多很多long-tern烦恼,所以请从我的网站下载并安装最新版本(2.1.4
) (Bitbucket Repository)。令人尴尬的是,即使是 CRAN 上的最后一个 2.1.3
版本,当 运行 在 grid.arrange
类型的情况下绘制两个图时,我也发现了一个非常重要的错误。这是剪贴蒙版的问题,已经解决 in 2.1.4
尚未发送到 CRAN,我计划立即进行。
无论如何,为了回答你的问题,请升级你的版本,你是 运行ning 版本 2.1.0
,这是在 ggplot2
中进行巨大修改后不久发布的版本 - - 事实上,就在不久之前,之前的版本被严重破坏,几乎需要 ggtern
的整个 re-writing,所以拥有完美的主题是我最不优先考虑的事情。在最近的版本中,由于我有时间细化和识别问题,这种行为应该已经得到解决——由以下两 (2) 个命令 运行 证明(按此顺序,来自干净的 session ),除了标题明显不同外,应该会产生相同的结果:
library(ggplot2)
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) +
geom_point() + theme_bw() +
labs(title='From ggplot2')
library(ggtern)
ggplot(data=mpg,aes(y=year,x=cyl)) +
geom_point() + theme_bw() +
labs(title='From ggtern')
如果我只能说,这可能看起来有点 off-topic,但整个问题实际上最初源于一件事,通过几度的分离。 ggplot2
的设计没有剪贴蒙版,它使用网格视口作为一个伪剪贴蒙版,因为它的所有绘图(极坐标变换除外)都在矩形区域上渲染。位于矩形区域之外的数据映射随后被视口丢弃。 ggtern
另一方面需要一个,因为它需要在位于 矩形 视口中的 三角形 形状的多边形区域中渲染 --众所周知,'三角形不适合方孔' 或者俗话说!当轴限制减少时,数据映射可以并且经常位于三角形区域之外,这些需要删除或屏蔽(或者如果用户愿意则显示)。删除不是一种选择,因为它会影响某些图,如多边形图、路径图、密度图或等高线图(我认为点几何可能是唯一不受潜在影响的几何图),这只剩下一个选项——剪贴蒙版的实现.在某些较早的版本中,未实现剪贴蒙版(有利于对数据进行子集化),因此需要修改基本主题元素。如果有的话,也许是最初的 'poor design',在许多代之后流传到令人沮丧的行为。