python 使用布尔掩码数组进行花式索引

python fancy indexing with a boolean masked array

我有一个 numpy 掩码数据数组:

data = masked_array(data = [7 -- 7 1 8 -- 1 1 -- -- 3 -- -- 3 --],
                    mask = [False True False False False True False False True True False True True False True])

我有一个特定类型数据的标志,它是一个布尔掩码数组:

flag = masked_array(data = [True False False True -- -- -- False -- True -- -- -- -- True],
                    mask = [False False False False True True True False True False True True True True False])

我想做类似 data[flag] 的事情并获得以下输出:

output_wanted = [7 1 -- --]

对应flag为True的数据元素。相反,我得到这个:

output_real = [7 -- 7 1 8 -- 1 1 -- -- 3 -- -- 3 --]

为了更清楚起见,我没有复制输出的掩码。

我不介意有一个标志大小的输出,只要它选择我想要的数据(对应于标志的真值的数据)。但我不明白为什么它会在实际输出中给出这些值!

像这样的东西怎么样:

import numpy as np
from numpy.ma import masked_array

data = masked_array(data = [7,     0,     7,     1,     8,     0,    1,     1,     0,    0,     3,     0,    0,    3,     0],
                    mask = [False, True,  False, False, False, True, False, False, True, True,  False, True, True, False, True])
flag = masked_array(data = [True,  False, False, True,  0,     0,    0,     False, 0,    True,  0,     0,    0,    0,     True],
                    mask = [False, False, False, False, True,  True, True,  False, True, False, True,  True, True, True,  False])

print(repr(data))
print(repr(flag))

indices = np.where(flag & ~flag.mask)
print(data[indices])

请注意,如果 flag 中的屏蔽值无法与 & 进行比较,您可能会遇到麻烦,但对您来说情况并非如此。

输出:

masked_array(data = [7 -- 7 1 8 -- 1 1 -- -- 3 -- -- 3 --],
             mask = [False  True False False False  True False False  True  True False  True  True False  True],
       fill_value = 999999)

masked_array(data = [1 0 0 1 -- -- -- 0 -- 1 -- -- -- -- 1],
             mask = [False False False False  True  True  True False  True False  True  True  True  True False],
       fill_value = 999999)

[7 1 -- --]

编辑:

另一种获取索引的方法也可能是:

indices = np.where(flag.filled(False))

更新(编辑 2):

注意使用数组索引数组的微妙之处。

考虑以下代码:

import numpy as np

data = np.array([1,2,3,4,5])
mask = np.array([True, False, True, False, True])

res  = data[mask]
print(res)

如你所料(也可能不料),这里mask起到了一个“过滤器”的作用,过滤掉mask中对应位置为False的数据元素。由于我为 datamask 选择的值,结果是索引用于过滤掉偶数 data 值,只留下奇数。

这里的输出是:[1 3 5].

现在,考虑非常相似代码:

import numpy as np

data = np.array([1,2,3,4,5])
mask = np.array([1, 0, 1, 0, 1])

res  = data[mask]
print(res)

在这里,唯一改变的是掩码元素的数据类型,它们的布尔值是相同的。我们称第一个掩码(由 True/False 值组成)mask1 和第二个掩码(由 1/0 值组成)mask2.

您可以通过 dtype 属性(例如 print(mask.dtype))检查数组的数据类型。 mask1 的数据类型为 bool,而 mask2 的数据类型为 int32

然而,这里的输出是不同的: [2 1 2 1 2].

这是怎么回事?

事实上,索引的行为因用于索引的数组的数据类型而异。如前所述,当“掩码”的数据类型为布尔值时,它具有过滤功能。但是当“掩码”的数据类型是整数时,它提供了一个“选择”功能,使用索引的元素作为原始数组的索引。

因此,在第二个示例中,由于 data[1] = 2data[0] = 1data[mask2] 的结果是长度为 5 的数组,而不是 3(在布尔情况下)。

换句话说,给定以下代码:

res = data[mask]

如果mask.dtype == int,res的长度将等于mask的长度。

如果mask.dtype == bool,res的长度将等于mask中True个值的个数。

差别很大。

最后,您可以使用 astype 方法将一种数据类型的数组强制转换为另一种数据类型。

演示片段:

import numpy as np

data = np.array([1,2,3,4,5])

# Create a boolean mask
mask1 = np.array([True, False, True, False, True])

# Create an integer "mask", using the same logical values 
mask2 = np.array([1,0,1,0,1])

# Coerce mask2 into a boolean mask
mask3 = mask2.astype(bool)

print(data)         # [1 2 3 4 5]
print("-" * 80)
print(mask1)        # [True  False  True  False  True]
print(mask1.dtype)  # bool
print(data[mask1])  # [1 3 5]
print("-" * 80)
print(mask2)        # [1 0 1 0 1]
print(mask2.dtype)  # int32
print(data[mask2])  # [2 1 2 1 2]
print("-" * 80)
print(mask3)        # [True  False  True  False  True]
print(mask3.dtype)  # bool
print(data[mask3])  # [1 3 5]

我弄清楚了使用屏蔽数组进行索引的工作原理。

事实上,python不处理这种索引。

当使用 flag 布尔掩码数组执行类似 data[flag] 的操作时,python 获取 flag 的基础数据。换句话说,它采用屏蔽值在被屏蔽之前的值。

所以请注意:如果屏蔽值未明确填充其 fill_value,索引可能看起来是随机的。

示例:

>>> arr = np.array([0, 1, 2, 3, 4])
>>> flag = np.ma.masked_array([True, False, False, True, True],
                              [False, True, False, False, True])

>>> arr[flag])
array([0, 3, 4])

一种方法就像jedwards answer。

但我认为应避免使用屏蔽数组来标记数据,它不会带来足够的洞察力。

对于用于访问特定类型数据的标志数组,掩码值应设置为False。例如,如果您想插入未标记的数据。

如果标志数组用于屏蔽某类数据,则屏蔽值应设置为True。

如果我用以下方法重建你的数组:

In [28]: d=np.ma.masked_equal([7,0,7,1,8,0,1,1,0,0,3,0,0,3,0],0)

In [29]: f=np.ma.MaskedArray([True,False,False,True, False,False,False,False,True,True,True,True,True,True,True],[False, False, False, False, True, True, True, False, True, False, True, True, True, True, False])

In [30]: d
Out[30]: 
masked_array(data = [7 -- 7 1 8 -- 1 1 -- -- 3 -- -- 3 --],
             mask = [False  True False False False  True False False  True  True False  True
  True False  True],
       fill_value = 0)

In [31]: f
Out[31]: 
masked_array(data = [True False False True -- -- -- False -- True -- -- -- -- True],
             mask = [False False False False  True  True  True False  True False  True  True
  True  True False],
       fill_value = True)

掩码显示匹配,但我在猜测掩码值是什么。

In [32]: d[f]
Out[32]: 
masked_array(data = [7 1 -- -- 3 -- -- 3 --],
             mask = [False False  True  True False  True  True False  True],
       fill_value = 0)

In [33]: d[f.data]
Out[33]: 
masked_array(data = [7 1 -- -- 3 -- -- 3 --],
             mask = [False False  True  True False  True  True False  True],
       fill_value = 0)

索引 f 与索引其 data 属性相同。它的面具什么都不做。显然我的掩码值与你的不同。

但是如果我使用 filled 数组进行索引,我会得到所需的数组:

In [34]: d[f.filled(False)]
Out[34]: 
masked_array(data = [7 1 -- --],
             mask = [False False  True  True],
       fill_value = 0)

fillednp.ma 代码中被大量使用,根据 np 操作具有不同的填充值(例如 0 表示求和 v 1 表示乘积)。屏蔽数组通常不会遍历它们的值而跳过屏蔽的数组;相反,他们将屏蔽的值转换为无害的值,并使用常规的 numpy 操作。另一种策略是使用 compressed.

删除屏蔽值

indices = np.where(flag.filled(False)) 在另一个答案中提到,但普通的布尔形式也同样有效。

掩码数组具有 datamask 属性。屏蔽不会直接更改 data 值。该任务留给 filled.

这样的方法