Tiff 中值滤波器导出为单帧 OpenCV Python

Tiff median filter exports as single frame OpenCV Python

我正在尝试让一个程序 运行 处理 60 帧的序列(在一个 tiff 文件中)并应用降噪过滤器(中值)以便在分析之前稍微清理一下帧.但是,我的程序(逐帧处理)将输出单帧 tiff;这是为什么?我该如何处理?

from PIL import Image
import cv2
import numpy as np

im = Image.open('example_recording.tif').convert('L')
im.save('greyscale_example.tif') #converts to greyscale

width,height = im.size
image_lookup = 0

class ImageSequence:
    def __init__(self, im):
        self.im = im
    def __getitem__(self, ix):
        try:
            if ix:
                self.im.seek(ix)
            return self.im
        except EOFError:
        raise IndexError # if end of sequence

for frame in ImageSequence(im):
        imarray = np.array(frame)
        Blur = cv2.medianBlur(imarray,5)
        frame = Image.fromarray(Blur)

im.save('corrected.tif')

我认为你没有正确地重新组合你的最终堆栈(上面没有显示?),并保存单个帧(最后一帧)?

另一种方法是放弃 OpenCV 并使用 scipy:

import numpy
import scipy
from scipy import ndimage

a = numpy.random.randint(0,255,(100,100,60))
a.shape
#(100L, 100L, 60L)

b = scipy.ndimage.filters.generic_filter(a, numpy.median, 5)
b.shape
#(100L, 100L, 60L)