Fortran:读取输入

Fortran: reading input

我正在尝试 运行 一个非常大的 FORTRAN 模型,所以我无法提供所有涉及的代码,但我希望我能提供足够的信息以使其有意义。 代码编译良好(使用 Intel 2016.0.109 编译器、OpenMPI 1.10.2 和 HDF5 1.8.17)。

当我尝试 运行 它时,它告诉我我的两个输入(称为 NZG 和 NZS)设置为 -999,因此它失败了。

> >>>>  opspec_grid  error! in your namelist!
>     ---> Reason:      Too few soil layers.  Set it to at least 2. Your nzg is currently set to -999...
>     ---> Reason:      Too few maximum # of snow layers. Set it to at least 1.  Your nzs is currently set to -999.

然而,在输入文件中,它们确实被指定为

   NL%NZG  = 9
   NL%NZS  = 1

我遍历了所有与这些变量有某种关系的模块,但找不到任何应该离开 rails 的地方。 所以我现在开始想,也许值的读取方式有问题。输入文件是一个文本文件。变量在读取它们的模块中指定为整数,仅供参考。 我应该检查特殊字符还是什么?我知道 Fortran 对输入很挑剔...

编辑:在追溯错误的代码序列下方

1)主模块开启名单

write (unit=*,fmt='(a)') 'Reading namelist information'
call read_nl(trim(name_name))

read_nl

subroutine read_nl(namelist_name)
   use ename_coms, only : nl              & ! intent(inout)
                        , init_ename_vars ! ! subroutine

   implicit none
   !----- Arguments. ----------------------------------------------------------------------!
   character(len=*), intent(in) :: namelist_name
   !----- Local variables. ----------------------------------------------------------------!
   logical                      :: fexists
   !----- Name lists. ---------------------------------------------------------------------!
   namelist /ED_NL/ nl
   !---------------------------------------------------------------------------------------!

   !----- Open the namelist file. ---------------------------------------------------------!
   inquire (file=trim(namelist_name),exist=fexists)
   if (.not. fexists) then
      call fatal_error('The namelist file '//trim(namelist_name)//' is missing.'           &
                      ,'read_nl','ed_load_namelist.f90')
   end if

   !----- Initialise the name list with absurd, undefined values. -------------------------!
   call init_ename_vars(nl) 

   !----- Read grid point and options information from the namelist. ----------------------!
   open (unit=10, status='OLD', file=namelist_name)
   read (unit=10, nml=ED_NL)
   close(unit=10)

   return
end subroutine read_nl

2) 然后是关于如何(哪些变量)从名单(输入)中读取的细节

write (unit=*,fmt='(a)') 'Copying namelist'
call copy_nl('ALL_CASES')  

if (runtype == 'HISTORY') then
  call copy_nl('HISTORY')
else
  call copy_nl('NOT_HISTORY')
end if

我的模拟是 'NOT_HISTORY':指定了 copy_nl('ALL_CASES'),因此它读取了一些名单变量,包括变量 'runtype' - 然后在该 if-else 语句中使用.

3) 然后copy_nl('NOT_HISTORY')就是下面的,这里是定义nzg和nzs的地方

subroutine copy_nl(copy_type)
use grid_coms            , only : time                      & ! intent(out)
                                   , centlon                   & ! intent(out)
                                   , centlat                   & ! intent(out)
                                   , deltax                    & ! intent(out)
                                   , deltay                    & ! intent(out)
                                   , nnxp                      & ! intent(out)
                                   , nnyp                      & ! intent(out)
                                   , nstratx                   & ! intent(out)
                                   , nstraty                   & ! intent(out)
                                   , polelat                   & ! intent(out)
                                   , polelon                   & ! intent(out)
                                   , ngrids                    & ! intent(out)
                                   , timmax                    & ! intent(out)
                                   , time                      & ! intent(out)
                                   , nzg                       & ! intent(out)
                                   , nzs                       ! ! intent(out)
implicit none
   !----- Arguments. ----------------------------------------------------------------------!
   character(len=*), intent(in) :: copy_type
   !----- Internal variables. -------------------------------------------------------------!
   integer                      :: ifm
   !---------------------------------------------------------------------------------------!

   !---------------------------------------------------------------------------------------!
   !     Here we decide which variables we should copy based on the input variable.        !
   !---------------------------------------------------------------------------------------!
select case (trim(copy_type))
case ('NOT_HISTORY')

  itimea        = nl%itimea
  idatea        = nl%idatea
  imontha       = nl%imontha
  iyeara        = nl%iyeara

  nzg           = nl%nzg
  nzs           = nl%nzs

  slz(1:nzgmax) = nl%slz(1:nzgmax)

  current_time%year  = iyeara
  current_time%month = imontha
  current_time%date  = idatea
  current_time%time  = real(int(real(itimea) * 0.01)) * hr_sec                         &
                     + (real(itimea) * 0.01 - real(int(real(itimea)*0.01)))            &
                     * 100.0 * min_sec
  time               = 0.0d0

请注意,我没有将所有模块和变量都放在 use 中,否则 post 会变得非常长。 仅供参考,模块 grid_coms 指定变量的类型。见下面相关部分(整个模块就是一个变量列表,没有别的)

module grid_coms
  integer :: nzg                            ! Number of soil levels
  integer :: nzs                            ! Number of snow/surface water levels
end module grid_coms

4) 回到主模块,然后调用 ed_opspec_grid 来检查变量是否有意义,这就是出错的地方。同样,use 变量在开始时被初始化,我把它留在这里。

subroutine ed_opspec_grid
!---------------------------------------------------------------------------------------!
   !      Check whether soil layers are reasonable, i.e, enough layers, sorted from the !
   ! deepest to the shallowest.                                                            !
   !---------------------------------------------------------------------------------------!
   if (nzg < 2) then
      write (reason,'(a,1x,i4,a)')                                                         &
            'Too few soil layers.  Set it to at least 2. Your nzg is currently set to'     &
           ,nzg,'...'
      call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
      ifaterr=ifaterr+1        
   elseif (nzg > nzgmax) then 
      write (reason,'(2(a,1x,i5,a))')                                                      &
            'The number of soil layers cannot be greater than ',nzgmax,'.'                 &
           ,' Your nzg is currently set to',nzg,'.'
      call opspec_fatal(reason,'opspec_grid') 
      ifaterr=ifaterr+1 
   end if
   do k=1,nzg
      if (slz(k) > -.001) then
         write (reason,'(a,1x,i4,1x,a,1x,es14.7,a)')                                       &
               'Your soil level #',k,'is not enough below ground. It is currently set to'  &
               ,slz(k),', make it deeper than -0.001...'
         call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
         ifaterr=ifaterr+1        
      end if
   end do

   do k=1,nzg-1
      if (slz(k)-slz(k+1) > .001) then
         write (reason,'(2(a,1x,i4,1x),a,2x,a,1x,es14.7,1x,a,1x,es14.7,a)')                &
               'Soil layers #',k,'and',k+1,'are not enough apart (i.e. > 0.001).'          &
              ,'They are currently set as ',slz(k),'and',slz(k+1),'...'
         call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
         ifaterr=ifaterr+1        
      end if
   end do
end subroutine ed_opspec_grid

请注意,这不是此子例程中的第一次检查。在此部分之前检查了其他变量(我将其排除在外),但这是第一条错误消息。这让我觉得也许部分输入可以正常读取,而有些则不能。

最后,再次强调一下,这是一个非常大的项目,我真的无法显示所有代码,这就是为什么我将问题框得很简单:Fortran是否有任何(文本)输入要求,我可能遗漏了(特殊字符,returns,可能因系统不同而不同?)。 另外,这段代码被很多研究人员在不同的平台上使用,所以我非常怀疑代码本身有什么问题......(但如果我错了请告诉我)。

你没有给我们足够的数据来查明问题,所以我只告诉你我在使用名单时遇到的两个问题:

  1. 如果您从同一个文件中读取多个(甚至不同的)名称列表,则顺序很重要:如果在文件名称列表中 a 在名称列表 b 之前,但代码读取首先是 b,然后它将找不到 a,除非您倒回文件。

  2. 如果数据文件中的名单不包含一个或多个值,这些值将保持不变。很可能在代码中这些变量被专门设置为 -999,以便注意到它们的缺失。所以仔细检查数据文件是否正确。查找可能会过早结束名单的 / 字符

总而言之,为了正确评估正在发生的事情,我们至少需要三件事:

  1. 声明块,包括构成此名单一部分的所有变量,以及namelist /.../ ...,...,...规范

  2. 声明此特定名单的名单文件部分,以及

  3. 是否有任何其他名称列表也在同一文件中,以及它们是否在此名称列表之前或之后(在文件中和代码中)