自动为 Graphviz 中的节点分配颜色

Question

我正在使用 Python 和 Graphviz 绘制一些由节点组成的聚类图。我想根据属性为每个节点分配不同的颜色，例如它的 x-coordinate.

以下是我生成图形的方法：

def add_nodes(graph, nodes):
    for n in nodes:
        if isinstance(n, tuple):
            graph.node(n[0], **n[1])
        else:
            graph.node(n)
    return graph

A = [[517, 1, [409], 10, 6], 
     [534, 1, [584], 10, 12], 
     [614, 1, [247], 11, 5], 
     [679, 1, [228], 13, 7], 
     [778, 1, [13], 14, 14]]

nodesgv = []

for node in A:
    nodesgv.append((str(node[0]),{'label': str(node[0]), 'color': ???, 'style': 'filled'}))

graph = functools.partial(gv.Graph, format='svg', engine='neato')
add_nodes(graph(), nodesgv).render(('img/test'))

现在我想根据每个节点的第一个值的顺序为每个节点分配一种颜色。更具体地说，我想要的是：

一个红色节点(517)
黄色节点(534)
绿色节点(614)
一个蓝色节点(679)
还有一个紫色节点(778)

我知道如何为图形分配颜色，但我正在寻找的是类似于使用 matplotlib 时的 c=x 部分的内容。

问题是我无法事先知道节点（集群）的数量，所以例如如果我有 7 个节点，我仍然想要一个有 7 个节点的图表，从红色节点开始，并且以紫色结尾。

plt.scatter(x, y, c=x, s=node_sizes)

那么Graphviz中有没有什么属性可以做到这一点？

或者谁能告诉我 matplotlib 中的颜色图是如何工作的？

很抱歉不清楚。 T^T

Answer 1

哦，我想出了一个方法来得到我想要的东西。只是为了记录和其他人可能有同样的问题（？）可以只重新缩放颜色图并将相应的索引（颜色）分配给节点。

def add_nodes(graph, nodes):
for n in nodes:
    if isinstance(n, tuple):
        graph.node(n[0], **n[1])
    else:
        graph.node(n)
return graph

A = [[517, 1, [409], 10, 6], 
     [534, 1, [584], 10, 12], 
     [614, 1, [247], 11, 5], 
     [679, 1, [228], 13, 7], 
     [778, 1, [13], 14, 14]]

nodesgv = []
Arange = [ a[0] for a in A]
norm = mpl.colors.Normalize(vmin = min(Arange), vmax = max(Arange))
cmap = cm.jet

for index, i in enumerate(A):
    x = i[0]
    m = cm.ScalarMappable(norm = norm, cmap = cmap)
    mm = m.to_rgba(x)
    M = colorsys.rgb_to_hsv(mm[0], mm[1], mm[2])
    nodesgv.append((str(i[0]),{'label': str((i[1])), 'color': "%f, %f, %f" % (M[0], M[1], M[2]), 'style': 'filled'}))

graph = functools.partial(gv.Graph, format='svg', engine='neato')
add_nodes(graph(), nodesgv).render(('img/test'))

自动为 Graphviz 中的节点分配颜色

Automatically assign color to nodes in Graphviz

python

plot

matplotlib

graphviz