如何制作具有具体值的热图

Question

我有这样的数据

df<- structure(list(name = structure(c(2L, 12L, 1L, 16L, 14L, 10L, 
9L, 5L, 15L, 4L, 8L, 13L, 7L, 6L, 3L, 11L), .Label = c("All", 
"Bab", "boro", "bra", "charli", "delta", "few", "hora", "Howe", 
"ist", "kind", "Kiss", "myr", "No", "TT", "where"), class = "factor"), 
    value = c(1.251, -1.018, -1.074, -1.137, 1.018, 1.293, 1.022, 
    -1.008, 1.022, 1.252, -1.005, 1.694, -1.068, 1.396, 1.646, 
    1.016)), .Names = c("name", "value"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-16L))

如下所示

#     name  value
#1     Bab  1.251
#2    Kiss -1.018
#3     All -1.074
#4   where -1.137
#5      No  1.018
#6     ist  1.293
#7    Howe  1.022
#8  charli -1.008
#9      TT  1.022
#10    bra  1.252
#11   hora -1.005
#12    myr  1.694
#13    few -1.068
#14  delta  1.396
#15   boro  1.646
#16   kind  1.016

当我绘制它时

ggplot(df, aes(x = 1,y = name, fill = value)) + 
  geom_tile() + 
  ylab("")

它随机绘制

但我想要与我的数据中的顺序相同。我也想让 ylim 变小，但我做不到。我感谢任何建议

Answer 1

问题是您的名称因素的级别按字母顺序排列。您要做的是重新排序 name 的级别。在情节之前这样做：

df$name <- factor(df$name, levels = df$name)

这将从下到上按原样打印值。对于从上到下的排序，请使用

df$name <- factor(df$name, levels = rev(df$name))

最后，设置 "ylim" 在这里没有任何意义。您可能想要降低 canvas 的高度（例如，通过更改 RStudio 中绘图窗格的大小）。

如何制作具有具体值的热图

how to make a heatmap with concrete values

plot

r

heatmap