正在解析具有未知列数的 Pandas 数据框以用于 statsmodels.api
Parsing a Pandas dataframe with an unknown number of columns for use in statsmodels.api
我想创建一个通用脚本来对多个数据集执行线性回归。每个数据集都有相同的 y 变量 "SM" 和未知数量的 x 变量。如果我确切知道哪些数据将用于回归,我就能够成功地做到这一点。例如:
import pandas
import statsmodels.api as sm
import statsmodels.formula.api as smf
from patsy import dmatrices
data = pandas.read_excel('test.xlsx')
然后,打印数据给出:
print data
SM Glass mag
SiO2 73.500 77.27 0.00
TiO2 0.233 0.15 7.37
Al2O3 11.230 11.49 0.00
FeO* 4.240 2.85 92.46
MnO 0.082 0.06 0.00
MgO 0.040 0.00 0.00
CaO 0.410 0.22 0.00
Na2O 5.630 4.58 0.00
K2O 4.620 3.38 0.00
然后我准备数据框并进行线性回归:
y, X = dmatrices('SM ~ Glass + mag', data=data, return_type='dataframe')
mod = sm.OLS(y, X)
res = mod.fit()
print res.summary()
这一切都很好。但是,我希望能够导入一个列数未知的 excel 文件,这样我就可以:
y, X = dmatrices('SM ~ X1 + X2 + X3 + ... Xn', data=data, return_type='dataframe')
我可以解析数据框并提取单独的列,但我不知道他们如何将它们放入进行线性回归所需的公式中。任何建议表示赞赏!
看看这是否有效:
df = pd.DataFrame(np.arange(20).reshape(2, 10), columns=list('abcdefghij'))
formula = '{} ~ {}'.format(df.columns[0], ' + '.join(df.columns[1:]))
formula
'a ~ b + c + d + e + f + g + h + i + j'
我想创建一个通用脚本来对多个数据集执行线性回归。每个数据集都有相同的 y 变量 "SM" 和未知数量的 x 变量。如果我确切知道哪些数据将用于回归,我就能够成功地做到这一点。例如:
import pandas
import statsmodels.api as sm
import statsmodels.formula.api as smf
from patsy import dmatrices
data = pandas.read_excel('test.xlsx')
然后,打印数据给出:
print data
SM Glass mag
SiO2 73.500 77.27 0.00
TiO2 0.233 0.15 7.37
Al2O3 11.230 11.49 0.00
FeO* 4.240 2.85 92.46
MnO 0.082 0.06 0.00
MgO 0.040 0.00 0.00
CaO 0.410 0.22 0.00
Na2O 5.630 4.58 0.00
K2O 4.620 3.38 0.00
然后我准备数据框并进行线性回归:
y, X = dmatrices('SM ~ Glass + mag', data=data, return_type='dataframe')
mod = sm.OLS(y, X)
res = mod.fit()
print res.summary()
这一切都很好。但是,我希望能够导入一个列数未知的 excel 文件,这样我就可以:
y, X = dmatrices('SM ~ X1 + X2 + X3 + ... Xn', data=data, return_type='dataframe')
我可以解析数据框并提取单独的列,但我不知道他们如何将它们放入进行线性回归所需的公式中。任何建议表示赞赏!
看看这是否有效:
df = pd.DataFrame(np.arange(20).reshape(2, 10), columns=list('abcdefghij'))
formula = '{} ~ {}'.format(df.columns[0], ' + '.join(df.columns[1:]))
formula
'a ~ b + c + d + e + f + g + h + i + j'