Panda 无法将数据存储在 HDF5 中？

Question

我正在尝试以 HDF5 格式存储大型数据帧，但我总是出错。我不应该使用好的方法来做到这一点，但我看不出我错在哪里。

这是我的代码：

import pandas as pd
import numpy as np

nrows=5
ncols=5

colnames=[]
for i in range(0,ncols):
    colnames.append('C'+str(i))

df = pd.DataFrame(np.random.randint(9,size=(nrows,ncols)),columns=colnames)

构建一个简单的数据框：

In [13]: df
Out[13]: 
   C0  C1  C2  C3  C4
0   1   4   5   5   3
1   8   2   7   1   4
2   2   7   6   4   2
3   8   2   4   3   3
4   8   6   5   3   6

现在当我尝试时：

df.to_hdf('test1.hdf','test',mode='w')

或：

df.to_hdf('test_table.hdf','test',format='table',mode='w')

我获得：

AttributeError: 'NoneType' object has no attribute '_f_close'

我也试试这个方法：

store = pd.HDFStore('data/store.h5', 'w')
store['df'] = df

但我得到：

AssertionError: stale weak reference to dead node ``/df/axis0``

正确的做法是什么？谢谢。

我正在使用： Python 3.4.1 pandas 0.15.2 表格 3.0.0

Answer 1

正如 James 在评论中所回答的那样，这只是更新到 Tables.

最新版本时修复的错误

Panda 无法将数据存储在 HDF5 中？

Can't store data in HDF5 with Panda?

python

pandas

hdf