在R中将多列值组合在一起

Question

所以我编写了一个代码，允许我将值放入单个列中。但是，我遇到的问题是我的数据包含在多个列中，所有列的长度都不同，并且其中包含 NA。我用于装箱的脚本是这样的：-

bin <- seq(min(data[, 1]), max(data[, 1]), by = 0.0005)
binnedData <- tapply(data[, 1], cut(data[, 1], breaks = bin), median)

我想知道是否有一种方法可以将所有列的所有值合并到一个巨大的长列中，这样我基本上就可以运行这个，或者是否有一种方法可以调整它我可以运行在我的 1000 x 1000 矩阵上

这取自我的部分数据：-

102.23144 123.23242 102.23145
103.23144 123.23242 102.36563
103.83637        NA 102.36356
104.23225        NA 102.23423
105.87890        NA        NA

以及仅组合列值的预期结果：-

分箱后的结果：-

(102.0000 - 102.0005) - Median of all values that fall into bin
(102.0005 - 102.0010) - Median of all values that fall into bin
(102.0015 - 102.0020) - Median of all values that fall into bin

谢谢

Answer 1

您是否尝试过使用 reshape2 包中的 melt 函数。

这是您的一些测试数据：

test <- data.frame(V1=c(102.2314,103.2314,103.8364,104.2322,105.8789),
                   V2=c(123.2324,123.2324,NA,NA,NA),
                   V3=c(102.2314,102.3656,102.3636,102.2342,NA)
                  )

> test
        V1       V2       V3
1 102.2314 123.2324 102.2314
2 103.2314 123.2324 102.3656
3 103.8364       NA 102.3636
4 104.2322       NA 102.2342
5 105.8789       NA       NA

然后使用熔化函数-

test_m <- melt(test)

但是有NA。

> test_m
   variable    value
1        V1 102.2314
2        V1 103.2314
3        V1 103.8364
4        V1 104.2322
5        V1 105.8789
6        V2 123.2324
7        V2 123.2324
8        V2       NA
9        V2       NA
10       V2       NA
11       V3 102.2314
12       V3 102.3656
13       V3 102.3636
14       V3 102.2342
15       V3       NA

所以，现在与此过滤器相同的步骤 -

test_m<- melt(test)[which(!(is.na(melt(test)[,2]))),]

> test_m
   variable    value
1        V1 102.2314
2        V1 103.2314
3        V1 103.8364
4        V1 104.2322
5        V1 105.8789
6        V2 123.2324
7        V2 123.2324
11       V3 102.2314
12       V3 102.3656
13       V3 102.3636
14       V3 102.2342

因此，NA 已删除。您可以 select 只有数据的第二列删除变量名称列。

Answer 2

如果您有 data.frame，这可以通过 base R

中的 stack 来完成

na.omit(stack(test))[,1,drop=FALSE]
#    values
#1  102.2314
#2  103.2314
#3  103.8364
#4  104.2322
#5  105.8789
#6  123.2324
#7  123.2324
#11 102.2314
#12 102.3656
#13 102.3636
#14 102.2342

或者

data.frame(V1= unname(na.omit(unlist(test))))

数据

test <- structure(list(V1 = c(102.2314, 103.2314, 103.8364, 104.2322, 
105.8789), V2 = c(123.2324, 123.2324, NA, NA, NA), V3 = c(102.2314, 
102.3656, 102.3636, 102.2342, NA)), .Names = c("V1", "V2", "V3"
), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5"))

在R中将多列值组合在一起

Combining multiple columns of values together in R

r

binning

数据