ggplot2：geom_smooth select 观察连接（相当于 geom_path()）

Question

我正在使用 ggplot2 创建海洋的垂直剖面。我的原始数据集创建 "spikes" 以制作平滑曲线。我希望使用 geom_smooth()。我还希望这条线根据观察的顺序（而不是根据 x 轴）前进。当我使用 geom_path() 时，它适用于原始图，但不适用于生成的 geom_smooth()（见下图）。

melteddf = Storfjorden %>% melt(id.vars = "Depth")
ggplot(melteddf, aes(y = Depth, x = value)) + 
  facet_wrap(~ variable, nrow = 1, scales = "free_x") + 
  scale_y_reverse() +
  geom_smooth(span = 0.5,se = FALSE) + 
  geom_path()

因此，有没有一种方法可以确保平滑曲线根据观察顺序而不是 a 轴进行？

我的数据子集：

head(Storfjorden)
      Depth Salinity Temperature Fluorescence
    1  0.72    34.14       3.738         0.01
    2  0.92    34.14       3.738         0.02
    3  1.10    34.13       3.739         0.03
    4  1.80    34.14       3.740         0.06
    5  2.80    34.13       3.739         0.02
    6  3.43    34.14       3.739         0.05

Answer 1

您提供的数据很少，但我们可以让它发挥作用。

使用一些 tidyverse 包，我们可以为每个 variables.

安装单独的 loess 函数

我们所做的，本质上是

我们的数据按 variable (group_by) 分组。
使用 do 为每个组拟合黄土函数。
使用 augment 从该黄土模型创建预测，在本例中为数据范围内的 1000 个值（对于 variable）。

.

# Load the packages
library(dplyr)
library(broom)

lo <- melteddf %>% 
  group_by(variable) %>% 
  do(augment(
    loess(value ~ Depth, data = .), 
    newdata = data.frame(Depth = seq(min(.$Depth), max(.$Depth), l = 1000))
  ))

现在我们可以在新的 geom_path 调用中使用该预测数据：

ggplot(melteddf, aes(y = Depth, x = value)) + 
  facet_wrap(~ variable, nrow = 1, scales = "free_x") + 
  scale_y_reverse() +
  geom_path(aes(col = 'raw')) +
  geom_path(data = lo, aes(x = .fitted, col = 'loess'))

（我将简单的字符向量映射到两条线的颜色以创建图例。）

ggplot2：geom_smooth select 观察连接（相当于 geom_path()）

ggplot2: geom_smooth select observations connections (equivalence to geom_path())

r

ggplot2

smooth

结果：