ppp 图中的图例

Question

我正在使用 spatstat 包和 ppp 函数创建基于 x-y 位置的树木空间地图。我已经能够做到这一点，每个点的大小都基于树的直径。我无法做的，我希望能在这里找到一些帮助，是创建一个图例，让我能够展示这些不同的圆圈，并将 6 种树种包括在地块中。这是我使用的代码：

df <- subset(plots, plots$spp == "DF")  # Douglas-fir

dfx <- as.numeric(as.character(df$x))
dfy <- as.numeric(as.character(df$y))
dfd <- as.numeric(as.character(df$d))

dfp <- ppp(dfx, dfy, window = owin(c(0, 100), c(0, 100)),
                  unitname=c("metres","metres"), marks = dfd)
par(mar = c(2, 2, 2, 2))                                           
plot(dfp, main = "", cex = 0.8, markscale = 0.04, 
     bg = rgb(0.1,0.9,0.3,0.5), fg = "black")

图中的每个物种都有相似的结构（对于西部铁杉，代码是相同的...）

谢谢！

Answer 1

首先使用 superimpose 将所有数据收集到一个 ppp 对象中。例如，如果您有花旗松 dfp 和西部铁杉 whp，则

  X <- superimpose(DF=dfp, WH=whp)

创建一个点模式 X，其中每个点都有两个标记值，种类和直径。为方便起见，更改标记列名称：

  colnames(marks(X)) <- c("diameter", "species")

接下来确定直径的绘图符号图（不绘制任何东西）：

  dmap <- plot(subset(X, select=diameter), do.plot=FALSE)

接下来为不同的物种选择一组颜色，例如

  spec <- levels(marks(X)$species)
  scol <- c("red", "blue")
  smap <- symbolmap(inputs=spec, col=scol)

现在使用直径比例图以不同颜色绘制物种：

  plot(Window(X), main="The main title")
  for(i in seq_along(spec)) {
     sy <- update(dmap, col=scol[i])
     Xi <- subset(X, species==spec[i], select=diameter)
     plot(Xi, add=TRUE, symap=sy)
  }

最后把dmap和smap这两个符号图画在你想要的地方，用plot(dmap, add=TRUE, xlim=..., ylim=...)等等。

将来这将是自动化的，但尚未实现。

ppp 图中的图例

Legend in ppp plot

ppp

spatstat