如何使用 plink 将 vcf 文件转换为 ped 文件？
How to convert vcf file to ped file using plink?
我正在尝试使用 plink 将 .vcf 文件转换为 .ped 文件。看了一些手册和网上的帖子，好像没有人专门提到如何把vcf转ped。
希望这里有高手有plink把vcf转ped的经验。如果您能分享这些知识，我将不胜感激。此外，如果有其他方法（非 plink），请分享。
谢谢！
我使用 VCFtools 将我的 vcf 文件转换为 PLINK 格式（ped、fam、map）：
https://vcftools.github.io/man_latest.html
我的命令是这样的：
vcftools --vcf my_data.vcf --out my_data --plink
Plink 提供了将 vcf（和其他格式）文件转换为 plink 兼容文件的功能。您要查找的命令是 recode，实际命令如下所示：
plink --vcf myfile.vcf.gz --recode --out myfile
我正在尝试使用 plink 将 .vcf 文件转换为 .ped 文件。看了一些手册和网上的帖子，好像没有人专门提到如何把vcf转ped。
希望这里有高手有plink把vcf转ped的经验。如果您能分享这些知识，我将不胜感激。此外，如果有其他方法（非 plink），请分享。
谢谢！
我使用 VCFtools 将我的 vcf 文件转换为 PLINK 格式（ped、fam、map）： https://vcftools.github.io/man_latest.html
我的命令是这样的：
vcftools --vcf my_data.vcf --out my_data --plink
Plink 提供了将 vcf（和其他格式）文件转换为 plink 兼容文件的功能。您要查找的命令是 recode，实际命令如下所示：
plink --vcf myfile.vcf.gz --recode --out myfile