用 R 中的列中位数进行插补

Question

如果我有一个向量，例如

vec <- c(3,4,5,NA)

我可以使用以下代码将 NA 替换为向量中其他值的中值：

vec[which(is.na(vec))] <- median(vec, na.rm = T)

但是，如果我有一个包含 NA 的矩阵，在矩阵的所有列上应用相同的代码不会返回一个矩阵，只会返回每个矩阵列的中位数。

mat <- matrix(c(1,NA,3,5,6,7,NA,3,4,NA,2,8), ncol = 3)
apply(mat, 2, function(x) x[which(is.na(x))] <- median(x, na.rm=T) )

#[1] 3 6 4

如何用列中位数替换 NA 来恢复矩阵？这个问题类似：Replace NA values by row means 但我无法根据我的情况调整任何解决方案。

Answer 1

在 apply 函数的最后一行添加 return(x) 即可解决。

> apply(mat, 2, function(x){
    x[which(is.na(x))] <- median(x, na.rm=T)
    return(x)
  })
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    1    6    4
[2,]    3    7    4
[3,]    3    6    2
[4,]    5    3    8

Answer 2

zoo中有一个方便的函数(na.aggregate)可以用指定的FUN替换NA元素。

library(zoo)
apply(mat, 2, FUN = function(x) na.aggregate(x, FUN = median))
#      [,1] [,2] [,3]
#[1,]    1    6    4
#[2,]    3    7    4
#[3,]    3    6    2
#[4,]    5    3    8

或者如@G.Grothendieck所说，na.aggregate可以直接应用在matrix

na.aggregate(mat, FUN = median)

用 R 中的列中位数进行插补

Imputation with column medians in R

r

matrix

apply