如何在 SimpleItk 中获取标签的中心坐标

Question

我正在为 C# 使用 SimpleITK 框架 (x64)。

在我做了一些操作和过滤后，我通过 LabelShapeStatisticsImageFilter 得到了一堆我感兴趣的标签。

如何获取特定标签的中心坐标？当我使用函数 GetCentroid 时，我得到了部分负面结果，我不知道如何处理这些数据。

提前致谢。

Answer 1

LabelShapeStatisticsImageFilter::GetCentroid 方法 returns 物理 space 中的一个点，而不是索引 space 中的一个点。这考虑了可能导致负值的图像的原点、间距和方向矩阵。要将结果转换为索引 space，您可以根据需要使用 Image::TransformPhysicalPointToContinuousIndex 或 Image::TransformPhysicalPointToIndex。

Answer 2

感谢您的回答和评论。

我在示例的评论中找到了问题的解决方案：

 // NOTE: As of April 8, 2015 the filter does not work with non-zero origins

所以我保存了 Origin 数据，将 Origin 设置为 (0,0) - 得到了一个有用的 Centroid 并更改了原始 Origin 的 Centroid 结果，最终再次将其设置为以前的值。

Answer 3

这是我的解决方案：

roi,是一个itk image file,前景值为1.

import SimpleITK as sitk
foreground_value = 1
label_statistic = sitk.LabelIntensityStatisticsImageFilter()
label_statistic.Execute(roi == foreground_value)
center_gravity = label_statistic.GetCenterGravity(1)
center_gravity_coordiate = roi.TransformPhysicalPointToIndex(center_gravity)

如何在 SimpleItk 中获取标签的中心坐标

How to get center coordinates of a label in SimpleItk

c#

itk