将 netcdf 文件提取到栅格中时出错

Question

我的文件夹中有很多 NCDF 文件。我尝试使用 raster 和 ncdf4 包将它们提取到光栅块中。如果我单独提取每个 NCDF 文件，它就可以工作。但是，我尝试使用 for 循环提取所有文件，然后出现错误。

R<-list.files("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/")
r<-brick(paste0("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/",R[[1]]),varname="T_min")

for(i in 2:length(R)){
r1<-brick(paste0("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/",R[[i]]),varname="T_min")
r<-brick(r,r1)
}

Error in as.integer(nl) : cannot coerce type 'S4' to vector of type 'integer'

如果我分别查看 r 和 r1，它们似乎具有相同的范围并且都是光栅砖类型：

> r
class       : RasterBrick 
dimensions  : 81, 81, 6561, 122  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 1, 1  (x, y)
extent      : 0.5, 81.5, 0.5, 81.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : NA 
data source : D:\Results\TimeSeries\NETCDF\timeseries_1km_2026.nc 
names       : X0026.05.02, X0026.05.03, X0026.05.04, X0026.05.05, X0026.05.06, X0026.05.07, X0026.05.08, X0026.05.09, X0026.05.10, X0026.05.11, X0026.05.12, X0026.05.13, X0026.05.14, X0026.05.15, X0026.05.16, ... 
Date        : 0026-05-02, 0026-08-31 (min, max)
varname     : T_min 

> r1
class       : RasterBrick 
dimensions  : 81, 81, 6561, 122  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 1, 1  (x, y)
extent      : 0.5, 81.5, 0.5, 81.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : NA 
data source : D:\Results\TimeSeries\NETCDF\timeseries_1km_2027.nc 
names       : X0027.05.02, X0027.05.03, X0027.05.04, X0027.05.05, X0027.05.06, X0027.05.07, X0027.05.08, X0027.05.09, X0027.05.10, X0027.05.11, X0027.05.12, X0027.05.13, X0027.05.14, X0027.05.15, X0027.05.16, ... 
Date        : 0027-05-02, 0027-08-31 (min, max)
varname     : T_min

请帮忙。

Answer 1

不需要循环，raster是向量化的，试试

p <- "D:/Results/TimeSeries/NETCDF"
R <- list.files(p, pattern = "nc$")

r <- raster::stack(file.path(p, R), varname = "T_min")

如果你确实需要循环，我会这样做：

r <- raster::stack(lapply(file.path(p, R), raster::raster, varname = "T_min"))

编辑：将 raster::raster 替换为 raster::stack。

另请注意 file.path 的使用以及 list.files 中可用的设施。（为文件路径粘贴文本可能会有问题，并且比使用可用函数更复杂）。

将 netcdf 文件提取到栅格中时出错

Error while extracting netcdf files into raster

r

s4

r-raster

netcdf4