Armadillo 仅当我在自己的库中使用它时才会出现链接错误
Armadillo linking error only if I use it in my own library
我在自己的图书馆中使用 Armadillo 时遇到了一些问题。我安装了 Armadillo,并创建了自己的库,它调用了 svd_econ 方法。这是 CMakeList.txt 文件:
cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME training_library)
project(${PROJECTNAME})
if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()
find_package(Armadillo REQUIRED)
include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")
add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)
include_directories(${ARMADILLO_INCLUDE_DIRS})
include_directories(${PROJECT_SOURCE_DIR}/include)
file(GLOB header include/*.h)
file(GLOB source src/*.cpp)
source_group("Source Files" FILES ${source})
source_group("Header Files" FILES ${header})
add_library(${PROJECTNAME} ${source} ${header})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${ARMADILLO_LIBRARIES})
这是头文件:
#include <algorithm>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <sstream>
#include <armadillo>
#include <Eigen/Dense>
#include <Eigen/SVD>
namespace statistics
{
bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues, Eigen::MatrixXd &eigenvectors);
}
#endif
这是.cpp:
#include "statistics.h"
namespace statistics
{
Eigen::MatrixXd convert(const arma::mat &data)
{
Eigen::MatrixXd res(data.n_rows,data.n_cols);
for (int i = 0; i < data.n_rows; i++)
{
for (int j = 0; j < data.n_cols; j++)
{
res(i,j) = data(i,j);
}
}
return res;
}
arma::mat convert(const Eigen::MatrixXd &data)
{
arma::mat res(data.rows(),data.cols());
for (int i = 0; i < data.rows(); i++)
{
for (int j = 0; j < data.cols(); j++)
{
res(i,j) = data(i,j);
}
}
return res;
}
Eigen::VectorXd convert(const arma::vec &data)
{
Eigen::VectorXd res(data.size());
for (int i = 0; i < data.size(); i++)
{
res(i) = data(i);
}
return res;
}
arma::vec convert(const Eigen::VectorXd &data)
{
arma::vec res(data.size());
for (int i = 0; i < data.size(); i++)
{
res(i) = data(i);
}
return res;
}
bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues, Eigen::MatrixXd &eigenvectors)
{
arma::mat arma_mat = convert(data);
arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
arma::svd_econ(U,S,V,arma_mat);
eigenvalues = convert(S)/sqrt((double)(data.rows()));
eigenvectors = convert(V);
return true;
}
}
现在,这个库编译没有任何问题。然后,我想从另一个名为 clean_data 的不同模块调用 findPCS 方法。它的 CMakeLists.txt 文件如下:
cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME clean_data)
project(${PROJECTNAME})
find_package(OpenCV REQUIRED)
find_package(Armadillo REQUIRED)
if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()
include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")
include_directories("$ENV{training_INCLUDE}")
link_directories("$ENV{training_LIBS}")
add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)
file(GLOB SOURCES *.c *.cpp)
add_executable(${PROJECTNAME} ${SOURCES})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)
调用findPCS方法的main.cpp如下:
#include <armadillo>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <ctime>
#include <algorithm>
#include <numeric>
#include <list>
#include <statistics.h>
#include <opencv2/opencv.hpp>
#include <Eigen/Dense>
int main() {
Eigen::MatrixXd matrix(4,10);
matrix << 1, 2, 2, 1, 5, 5, 4, 12, 32, 1,
44, 34, 12, 11, 21, 5, 54, 1, 12, 3,
33, 128, 112, 126, 3, 3, 2, 12, 1, 54,
66, 34, 1, 54, 2, 2, 1, 43, 4, 12;
Eigen::VectorXd eigenval; Eigen::MatrixXd eigenvec;
statistics::findPCS(matrix,eigenval,eigenvec);
//arma::mat x = arma::randu<arma::mat>(3,4);
//arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
//arma::svd(U,S,V,x);
return 0;
}
这段代码,当我尝试编译时,给出了这个链接错误:
/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o): In function `gesdd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:571: undefined reference to `wrapper_dgesdd_'
/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o): In function `gesvd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined reference to `wrapper_dgesvd_'
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined reference to `wrapper_dgesvd_'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[2]: *** [clean_data] Error 1
make[1]: *** [CMakeFiles/clean_data.dir/all] Error 2
make: *** [all] Error 2
但是,如果我对 main.cpp 中注释的行进行反注释,代码编译没有任何问题,它运行良好,并给出了正确的结果!我在网上查了一下,找不到任何有用的答案。我正在使用 Ubuntu 14.04。我从源代码安装了 armadillo,从 synaptic 安装了 lapack、blas 和 openblas。任何人都可以在任何地方发现问题吗?任何帮助将不胜感激。
谢谢,
伊拉里亚
您的问题归结为库链接顺序。我不知道你的完整链接行,但这里是一个说明问题的简化:
gcc -o myOutput main.o -l someLibrary -l training_library
现在 training_library.a
包含对外部符号的引用:特别是 wrapper_dgesvd_
等。这些实际上是在 someLibrary.a
中定义的(我不知道这里的实际库名称,所以使用这个名字来说明我的观点)。但是,由于上面的 -l
顺序,它们无法解析(规则是链接器行上未解析的符号从左到右处理,只有 -l
条目出现在引入未解析符号的点可以解析它)。
那么为什么取消注释 main.cpp
中的行会有帮助?因为在注释行中进行调用可能(在幕后)引用了那些相同的未解析符号(例如 wrapper_dgesvd_
)。因为这些现在被引入到 -l someLibrary
的左侧,所以现在可以用来解决它们,因此它们被拉入。一旦被拉入,它们现在也可用于稍后出现在命令行中的东西,即对于training_library
,所以你之前的问题就消失了。
如何解决这个问题?只是猜测,但请尝试将 CMake
行从:
更改为
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)
收件人:
target_link_libraries(${PROJECTNAME} training_library ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES})
我在自己的图书馆中使用 Armadillo 时遇到了一些问题。我安装了 Armadillo,并创建了自己的库,它调用了 svd_econ 方法。这是 CMakeList.txt 文件:
cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME training_library)
project(${PROJECTNAME})
if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()
find_package(Armadillo REQUIRED)
include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")
add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)
include_directories(${ARMADILLO_INCLUDE_DIRS})
include_directories(${PROJECT_SOURCE_DIR}/include)
file(GLOB header include/*.h)
file(GLOB source src/*.cpp)
source_group("Source Files" FILES ${source})
source_group("Header Files" FILES ${header})
add_library(${PROJECTNAME} ${source} ${header})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${ARMADILLO_LIBRARIES})
这是头文件:
#include <algorithm>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <sstream>
#include <armadillo>
#include <Eigen/Dense>
#include <Eigen/SVD>
namespace statistics
{
bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues, Eigen::MatrixXd &eigenvectors);
}
#endif
这是.cpp:
#include "statistics.h"
namespace statistics
{
Eigen::MatrixXd convert(const arma::mat &data)
{
Eigen::MatrixXd res(data.n_rows,data.n_cols);
for (int i = 0; i < data.n_rows; i++)
{
for (int j = 0; j < data.n_cols; j++)
{
res(i,j) = data(i,j);
}
}
return res;
}
arma::mat convert(const Eigen::MatrixXd &data)
{
arma::mat res(data.rows(),data.cols());
for (int i = 0; i < data.rows(); i++)
{
for (int j = 0; j < data.cols(); j++)
{
res(i,j) = data(i,j);
}
}
return res;
}
Eigen::VectorXd convert(const arma::vec &data)
{
Eigen::VectorXd res(data.size());
for (int i = 0; i < data.size(); i++)
{
res(i) = data(i);
}
return res;
}
arma::vec convert(const Eigen::VectorXd &data)
{
arma::vec res(data.size());
for (int i = 0; i < data.size(); i++)
{
res(i) = data(i);
}
return res;
}
bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues, Eigen::MatrixXd &eigenvectors)
{
arma::mat arma_mat = convert(data);
arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
arma::svd_econ(U,S,V,arma_mat);
eigenvalues = convert(S)/sqrt((double)(data.rows()));
eigenvectors = convert(V);
return true;
}
}
现在,这个库编译没有任何问题。然后,我想从另一个名为 clean_data 的不同模块调用 findPCS 方法。它的 CMakeLists.txt 文件如下:
cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME clean_data)
project(${PROJECTNAME})
find_package(OpenCV REQUIRED)
find_package(Armadillo REQUIRED)
if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()
include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")
include_directories("$ENV{training_INCLUDE}")
link_directories("$ENV{training_LIBS}")
add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)
file(GLOB SOURCES *.c *.cpp)
add_executable(${PROJECTNAME} ${SOURCES})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)
调用findPCS方法的main.cpp如下:
#include <armadillo>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <ctime>
#include <algorithm>
#include <numeric>
#include <list>
#include <statistics.h>
#include <opencv2/opencv.hpp>
#include <Eigen/Dense>
int main() {
Eigen::MatrixXd matrix(4,10);
matrix << 1, 2, 2, 1, 5, 5, 4, 12, 32, 1,
44, 34, 12, 11, 21, 5, 54, 1, 12, 3,
33, 128, 112, 126, 3, 3, 2, 12, 1, 54,
66, 34, 1, 54, 2, 2, 1, 43, 4, 12;
Eigen::VectorXd eigenval; Eigen::MatrixXd eigenvec;
statistics::findPCS(matrix,eigenval,eigenvec);
//arma::mat x = arma::randu<arma::mat>(3,4);
//arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
//arma::svd(U,S,V,x);
return 0;
}
这段代码,当我尝试编译时,给出了这个链接错误:
/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o): In function `gesdd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:571: undefined reference to `wrapper_dgesdd_'
/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o): In function `gesvd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined reference to `wrapper_dgesvd_'
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined reference to `wrapper_dgesvd_'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[2]: *** [clean_data] Error 1
make[1]: *** [CMakeFiles/clean_data.dir/all] Error 2
make: *** [all] Error 2
但是,如果我对 main.cpp 中注释的行进行反注释,代码编译没有任何问题,它运行良好,并给出了正确的结果!我在网上查了一下,找不到任何有用的答案。我正在使用 Ubuntu 14.04。我从源代码安装了 armadillo,从 synaptic 安装了 lapack、blas 和 openblas。任何人都可以在任何地方发现问题吗?任何帮助将不胜感激。
谢谢, 伊拉里亚
您的问题归结为库链接顺序。我不知道你的完整链接行,但这里是一个说明问题的简化:
gcc -o myOutput main.o -l someLibrary -l training_library
现在 training_library.a
包含对外部符号的引用:特别是 wrapper_dgesvd_
等。这些实际上是在 someLibrary.a
中定义的(我不知道这里的实际库名称,所以使用这个名字来说明我的观点)。但是,由于上面的 -l
顺序,它们无法解析(规则是链接器行上未解析的符号从左到右处理,只有 -l
条目出现在引入未解析符号的点可以解析它)。
那么为什么取消注释 main.cpp
中的行会有帮助?因为在注释行中进行调用可能(在幕后)引用了那些相同的未解析符号(例如 wrapper_dgesvd_
)。因为这些现在被引入到 -l someLibrary
的左侧,所以现在可以用来解决它们,因此它们被拉入。一旦被拉入,它们现在也可用于稍后出现在命令行中的东西,即对于training_library
,所以你之前的问题就消失了。
如何解决这个问题?只是猜测,但请尝试将 CMake
行从:
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)
收件人:
target_link_libraries(${PROJECTNAME} training_library ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES})