ImageIO.read 正在偶尔读取图像文件

Question

我正在使用以下 Java 代码读取 Dicom 图像，稍后尝试将其转换为 JPEG 文件。当读取发生在行

tempImage = ImageIO.read(dicomFile);

，返回图像的图像类型为 10 或其他类型，例如 0 或 11。这里的问题是读取偶尔发生。有时返回的图像类型是 10，有时不是。当返回的图像类型为 10 时，转换后的 JPEG 文件的写入成功并且 returns 为真，我得到了我的 JPEG 文件。但是，当返回的图片类型不是10时，写入失败，returns false，不产生任何文件。这是我用来写作的声明：

writerReturn = ImageIO.write(image, "jpeg", new File(tempLocation + studyId + File.separator + seriesUID + File.separator + objectId + thumbnail+ ".jpeg"));

我花了很长时间试图弄清楚为什么会发生这种零星的行为，但无法解决任何问题。你能帮忙吗？

Answer 1

我猜问题是您的输入图像是 16 位，而我确定您的代码只接受 8 位输入。你不能使用所谓的通常的 JPEG 8 位有损格式写出，除非你转换你的 16 位输入。

在我的盒子上，这是我看到的：

$ gdcminfo 1.2.840.113619.2.67.2200970061.29232060605151433.387
MediaStorage is 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.1.1 [Digital X-Ray Image Storage - For Presentation]
TransferSyntax is 1.2.840.10008.1.2.4.90 [JPEG 2000 Image Compression (Lossless Only)]
NumberOfDimensions: 2
Dimensions: (1887,1859,1)
SamplesPerPixel    :1
BitsAllocated      :16
BitsStored         :14
HighBit            :13
PixelRepresentation:0
ScalarType found   :UINT16
PhotometricInterpretation: MONOCHROME2 
PlanarConfiguration: 0
TransferSyntax: 1.2.840.10008.1.2.4.90
Group           0x6000
Rows            1859
Columns         1887
NumberOfFrames  0
Description     
Type            G 
Origin[2]       1,1
FrameOrigin     0
BitsAllocated   1
BitPosition     0
Origin: (0,0,0)
Spacing: (0.187429,0.187429,1)
DirectionCosines: (1,0,0,0,1,0)
Rescale Intercept/Slope: (0,1)
Orientation Label: AXIAL

因此，如果您想说服自己，您可以提取封装的 JPEG 2000 字节流：

$ gdcmraw 1.2.840.113619.2.67.2200970061.29232060605151433.387 bug.j2k
$ file bug.j2k 
bug.j2k: JPEG 2000 codestream

我能够使用 IrfanView 和 kdu_show 打开生成的 bug.j2k，但是正如您所见，图像非常暗（只读取了低位）。

Answer 2

根据评论中的额外信息，我们发现该应用程序运行正在 Glassfish 服务器中运行，并且 安装了两个 ImageIO 插件，两者能够读取 DICOM 图像。问题与读取无关，但有时将解码图像写入JPEG会失败。

上述插件的服务提供商是 org.dcm4cheri.imageio.plugins.DcmImageReaderSpi 和 org.dcm4che2.imageioimpl.plugins.dcm.DicomImageReaderSpi，但只有后者 (DicomImageReaderSpi) 似乎有效。这是因为每个样本 BufferedImage 产生 8 位，这是 JPEGImageWriter 能够写入的（DcmImageReaderSpi 每个样本图像创建 16 位，这是无法写入的作为 JFIF JPEG，因此不受 JPEGImageWriter) 支持。

由于 ImageIO 插件的（默认）未指定（读取：不可预测）顺序，结果是有时您获得 8 bps 版本，有时获得 16 位版本的图像，最终结果是有时转换不起作用。

现在，好消息是我们可以 设置 ImageIO 插件的明确顺序，或者我们可以 在运行时间取消注册 插件，以获得稳定的可预测结果。这些选项中哪个更好，取决于您的服务器上是否有其他代码依赖于不需要的插件。如果不需要，请注销。

下面的代码显示了以上两个选项：

// Get the global registry
IIORegistry registry = IIORegistry.getDefaultInstance();

// Lookup the known providers
ImageReaderSpi goodProvider = lookupProviderByName(registry, "org.dcm4che2.imageioimpl.plugins.dcm.DicomImageReaderSpi");
ImageReaderSpi badProvider = lookupProviderByName(registry, "org.dcm4cheri.imageio.plugins.DcmImageReaderSpi");

if (goodProvider != null && badProvider != null) {
    // If both are found, EITHER
    // order the good provider BEFORE the bad one
    registry.setOrdering(ImageReaderSpi.class, goodProvider, badProvider);

    // OR
    // un-register the bad provider
    registry.deregisterServiceProvider(badProvider);
}

// New and improved (shorter) version. :-)
private static <T> T lookupProviderByName(final ServiceRegistry registry, final String providerClassName) {
    try {
        return (T) registry.getServiceProviderByClass(Class.forName(providerClassName));
    }
    catch (ClassNotFoundException ignore) {
        return null;
    }
}

您还应该确保只运行此代码一次，对于基于容器的应用程序，应用程序上下文启动是一个很好的时机。

通过上述解决方案，ImageIO.read(...) 将始终使用好的插件，并且 ImageIO.write(...) 将按预期工作。

ImageIO.read 正在偶尔读取图像文件

ImageIO.read is sporadically reading an image file

image

dicom

javax.imageio

dcm4che