安装 'ReporteRs' 和 'ReporteRsjars' 时出错

Error installing 'ReporteRs' and 'ReporteRsjars'

最终我试图在 Windows 7 系统上安装 R 包 ReporteRs (ReporteRs_0.8.7.tar.gz)(会话信息,和其他信息如下)。这取决于我遇到安装错误的包 ReporteRsjars (ReporteRsjars_0.0.2.tar.gz)。

这也取决于安装的 R 包 rJava 以及 JDK/JRE (jre1.8.0_112).

我正在一台无法访问互联网的机器上进行安装,因此我是通过内置 PACKAGESPACKAGES.gz 的本地版本的 CRAN 执行此操作。这一直没有任何问题(至少现在是这样)。

rJava 加载没有任何问题,但是在安装 ReporteRsjars 时,出现以下错误(请参阅下面的 Install Attempt ERROR)。

注意: 其他 Whosebug 问题似乎更关注 library(rJava) 问题,而不是在安装依赖于 rJava.

的软件包时

rJava DLL 位于以下位置:

C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/rJava/libs/x64/rJava.dll

已重新安装多次(成功)。

sessionInfo 和更多信息在错误下方(包括我尝试过的)。

安装尝试错误

cran_dir_url设置为CRAN包所在的路径。这是前缀 file://

> library(rJava)
> install.packages('ReporteRsjars', contriburl=cran_dir_url, repos = cran_dir_url, type = 'source')

## * installing *source* package 'ReporteRsjars' ...
## ** package 'ReporteRsjars' successfully unpacked and MD5 sums checked
## ** R
## ** inst
## ** preparing package for lazy loading
## ** help
## No man pages found in package  'ReporteRsjars' 
## *** installing help indices
## ** building package indices
## ** testing if installed package can be loaded
## *** arch - i386
## Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
##   call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
##   error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
## Error: loading failed
## Execution halted
## *** arch - x64
## ERROR: loading failed for 'i386'
## * removing 'C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/ReporteRsjars'
## Warning in install.packages :
##   running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.3.2\library" /Users/cirina_ext/Documents/StevenBanville/CRAN_Targeted/ReporteRsjars_0.0.2.tar.gz' had status 1
## Warning in install.packages :
##   installation of package 'ReporteRsjars' had non-zero exit status
## 

环境信息和工具

路径信息:以下包含在系统路径中,是安装Java的位置。

C:\Program Files\Java\jre1.8.0_112\bin\;C:\Program Files\Java\jre1.8.0_112\bin\server\;%path%

(JDK 安装程序:jdk-8u112-windows-x64)

Rtools 版本和位置

版本:3.4.0.1962 地点:C:\Rtools

我试过的

如果能提供帮助我排查和解决此问题的指南,我们将不胜感激。

会话信息

> sessionInfo('rJava')
## R version 3.3.2 (2016-10-31)
## Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
## Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
## 
## locale:
## [1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
## [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
## [5] LC_TIME=English_United States.1252    
## 
## attached base packages:
## character(0)
## 
## other attached packages:
## [1] rJava_0.9-8
## 
## loaded via a namespace (and not attached):
## [1] graphics_3.3.2  tools_3.3.2     utils_3.3.2     grDevices_3.3.2 stats_3.3.2     datasets_3.3.2 
## [7] methods_3.3.2   base_3.3.2     

编辑

我尝试在另一台只有 64 位版本 Java 的机器上进行相同的安装(并确认它是 64 位),但遇到了同样的错误。这是一个片段,但它与上面的错误相同:

...
*** arch - i386
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
  error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
Error: loading failed
Execution halted
...

我仍在查看@42- 评论中的 link,但这看起来不像 JRE/JDK 不是 64 位的问题。

编辑 2

注意:这不是作为答案发布,因为它只是一种解决方法。

我找到了一个不太理想的解决方法。似乎本地 CRAN 副本的安装与我预期的不太相似。我使用非本地 CRAN(即通常的方式)在等效的 Windows 7 机器上安装了有问题的库安装,并将目录复制到另一台机器(即未连接到互联网的机器)。这似乎有效,但不清楚为什么另一种方法无效(使用更新的 PACKAGES 文件的本地 CRAN 副本)。我注意到的一件事是,在访问通常的 CRAN 存储库时,它使用了 .zip 版本的库,而不是 tar.gz;我不确定这是否重要。

编辑 3

根据 David Gohel 在 ReporteRs Issues 中的回复,添加了 INSTALL_opts = "--no-multiarch" 的以下代码可能会解决此问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source', INSTALL_opts = "--no-multiarch")

如果我确定它可以解决问题,我会将其添加为答案,但是,我已经实施了 EDIT 2.

中提到的解决方法

根据 David Gohel 在此 GitHub ReporteRs Issues 中的回复,添加了 INSTALL_opts = "--no-multiarch" 的以下代码解决了我遇到的问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source',
                 INSTALL_opts = "--no-multiarch")

编辑

变量cran_dir_url 应指向包含.tar.gz 安装包文件的目录。可以使用的两个路径示例如下:

# (*) Web: URL pointing to CRAN
cran_dir_url <- "https://cloud.r-project.org/src/contrib"

# (*) Local: Pointing to local copy of CRAN (or whatever local packages you
# would like to install).
# Note: this example is a Mac OS path with username "someuser".
# Note: the three "/" chars are correct ("file://" followed by "/Users/..." => "file:///Users/..."
cran_dir_url <- "file:///Users/someuser/CRAN_Local/"

在上面两个路径(http和file)里面,会有.tar.gz个文件(例如ggplot2_3.3.5.tar.gz)。