按组处理列表列表

Question

我想处理一个列表列表。具体来说，我想通过分组变量（每个列表的第一个成员）提取作为每个列表的第三个成员的数据框，然后使用多个函数，如 mean()、median()、sd()、length() 等该组中的数据。然后输出在数据框中返回，看起来像：

Grp   mean sd  ... 
 a    5.26 ... ...
 b    6.25 ... ...

#fake data
test<-list(
         #member 1=grouping var, 2=identity, 3=dataframe
         list("a", 54, data.frame(x=c(1,2)  ,y=c(3,4))),
         list("b", 55, data.frame(x=c(5,6)  ,y=c(7,8))),
         list("a", 56, data.frame(x=c(9 ,10),y=c(11,12))),
         list("b", 57, data.frame(x=c(13,14),y=c(15,NA)))
         )

#what I thought could work but kicks out a strange error

test2 <-ldply(test, .fun=unlist)
#note limited to just mean for now
tapply(test, factor(test$V1), FUN=function(x){mean(as.numeric(x[3:6]), na.rm=TRUE)}, simplify=TRUE)

所以我的问题是： 1.为什么以上不起作用？ 2. 感觉很笨重，有没有更高效的方法呢？

Answer 1

在基础 R 中你可以这样做：

df_list <- tapply(test, 
                  sapply(test, `[[`,1), 
                  FUN=function(x) do.call(rbind,lapply(x, `[[`,3)))
t(sapply(df_list, function(x){
  list("mean"=mean(unlist(x), na.rm = T),
       "sd"=sd(unlist(x), na.rm = T),
       "median"=median(unlist(x), na.rm = T))}))

  mean     sd       median
a 6.5      4.440077 6.5   
b 9.714286 4.151879 8

按组处理列表列表

Processing lists of lists by group

r

plyr

tapply

split-apply-combine