reshape2 和宽（推算）时间变量

Question

我知道 base R 的 reshape 可以转换为长格式，其中时间是根据存根变量名称 A 和 B 估算的，例如：

wide = data.frame(A.2010 = c('a', 'b', 'c'),
                  A.2011 = c('f', 'g', 'd'),
                  B.2010 = c('A', 'B', 'C'),
                  B.2011 = c('G', 'G', 'H'),
                  z = runif(3),
                  x = runif(3))

wide
#  A.2010 A.2011 B.2010 B.2011         z          x
#1      a      f      A      G 0.3626823 0.67212468
#2      b      g      B      G 0.3726911 0.09663248
#3      c      d      C      H 0.9807237 0.31259394

变成：

reshape(wide, direction = 'long', sep = '.',
        varying = c('A.2010', 'A.2011', 'B.2010', 'B.2011'))
#               z          x time A B id
#1.2010 0.3626823 0.67212468 2010 a A  1
#2.2010 0.3726911 0.09663248 2010 b B  2
#3.2010 0.9807237 0.31259394 2010 c C  3
#1.2011 0.3626823 0.67212468 2011 f G  1
#2.2011 0.3726911 0.09663248 2011 g G  2
#3.2011 0.9807237 0.31259394 2011 d H  3

我可以用 reshape2::melt 完成同样的事情吗？

Answer 1

似乎 base r 中的 reshape 是执行此操作的最佳工具，因为 reshape2 包中的 melt 函数中没有类似的功能。但是，您可以使用 melt.data.table:

中的 patterns 函数实现类似的功能

library(reshape2)
library(data.table)

wide = data.table(wide)

long = melt(wide, id.vars = c("z", "x"), measure = patterns("^A", "^B"),
            value.name = c("A", "B"), variable.name = "time")

> long
           z         x time A B
1: 0.3421681 0.8432707    1 a A
2: 0.1243282 0.5096108    1 b B
3: 0.3650165 0.1441660    1 c C
4: 0.3421681 0.8432707    2 f G
5: 0.1243282 0.5096108    2 g G
6: 0.3650165 0.1441660    2 d H

请注意，melt 识别出不同的 "time"，并将它们正确分组，但没有按需要使用 2010 和 2011。解决方法是手动重新编码级别，这应该是微不足道的。

levels(long$time) = c("2010", "2011")

> long
           z         x time A B
1: 0.3421681 0.8432707 2010 a A
2: 0.1243282 0.5096108 2010 b B
3: 0.3650165 0.1441660 2010 c C
4: 0.3421681 0.8432707 2011 f G
5: 0.1243282 0.5096108 2011 g G
6: 0.3650165 0.1441660 2011 d H

希望对您有所帮助！

reshape2 和宽（推算）时间变量

reshape2 and wide (imputed) time variables

r

reshape2

melt