蛇制作 + tmux

Snakemake + tmux

我的工作流程通常包括向共享集群提交 PBS 作业,这些作业需要在调度队列中等待,需要 24 小时到 运行 或两者兼而有之。我想在 'background' 中 运行 snakemake 并在这些工作 运行ning 时得到我的提示。我知道这可以使用 tmuxscreen& 来完成,但是有更好的方法吗?

我想提交一个包含 snakemake 命令的 bash 包装器脚本是一个选项,但我认为我对工作流程缺乏一些了解。

tmux 是执行 Snakemake 工作流程的推荐方式。无论您是在集群中还是在计算服务器上,它都会为您提供所需的一切。