Spark:读取分区镶木地板数据中的 DateType 列时出错
Spark: error reading DateType columns in partitioned parquet data
我在 S3 中有镶木地板数据,按 nyc_date 分区,格式为 s3://mybucket/mykey/nyc_date=Y-m-d/*.gz.parquet
。
我有一个 DateType 列 event_date
当我尝试使用 EMR 从 S3 读取并写入 hdfs 时出于某种原因抛出此错误。
from pyspark.sql import SparkSession
spark = SparkSession.builder.enableHiveSupport().getOrCreate()
df = spark.read.parquet('s3a://mybucket/mykey/')
df.limit(100).write.parquet('hdfs:///output/', compression='gzip')
错误:
java.lang.UnsupportedOperationException: org.apache.parquet.column.values.dictionary.PlainValuesDictionary$PlainBinaryDictionary
at org.apache.parquet.column.Dictionary.decodeToInt(Dictionary.java:48)
at org.apache.spark.sql.execution.vectorized.OnHeapColumnVector.getInt(OnHeapColumnVector.java:233)
at org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.GeneratedClass$GeneratedIterator.processNext(Unknown Source)
at org.apache.spark.sql.execution.BufferedRowIterator.hasNext(BufferedRowIterator.java:43)
at org.apache.spark.sql.execution.WholeStageCodegenExec$$anonfun$$anon.hasNext(WholeStageCodegenExec.scala:370)
at scala.collection.Iterator$$anon.hasNext(Iterator.scala:389)
at scala.collection.Iterator$$anon.hasNext(Iterator.scala:408)
at org.apache.spark.shuffle.sort.BypassMergeSortShuffleWriter.write(BypassMergeSortShuffleWriter.java:125)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:79)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:47)
at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:86)
at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:274)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1142)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:617)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
这是我得出的结论:
- 本地工作:-): 我在本地以相同的格式复制了一些数据,可以正常查询。
- 避免选择 event_date 有效 :-):选择所有 50 多列,但
event_date
不会导致任何错误。
- 显式读取路径抛出错误:-(: 将读取路径更改为
's3a://mybucket/mykey/*/*.gz.parquet'
仍然抛出错误。
- 指定模式仍然会引发错误:-(: 在加载之前指定模式仍然会导致相同的错误。
- 我可以将包括 eastern_date 在内的数据加载到数据仓库中:-)。
真的很奇怪,这只会导致 DateType 列出错。我没有任何其他 DateType 列。
使用 Spark 2.0.2 和 EMR 5.2.0。
我在写 parquet 时只是使用了 StringType 而不是 DateType。没有问题了。
我知道我迟到了...
我遇到了类似的问题。我读了几个 parquet 目录,将它们联合起来,并尝试编写。
我的解决方法是在写入之前添加一个 .select(...)。
当 Spark 读取从 JSON 文件生成的 Parquet 文件时,我遇到了这个异常。
TLDR: 如果可能,使用强制应用的预期模式重写输入 Parquet。
以下 Scala 代码。 Python不会有太大的不同。
这几乎就是我的 Parquet 一代最初的样子:
spark.read
.format("json")
.load("<path-to-json-file>.json")
.write
.parquet("<path-to-output-directory>")
但是读取上述 Parquet 的 Spark 作业正在对输入强制执行模式。大概是这样的:
val structType: StructType = StructType(fields = Seq(...))
spark.read.schema(structType)
以上是异常发生的地方。
修复:
为了修复异常,我不得不将模式强制应用于我生成的数据:
spark.read
.schema(structType) // <===
.format("json")
.load("<path-to-json-file>.json")
.write
.parquet("<path-to-output-directory>")
据我了解,在我的案例中出现异常的原因不(仅)是 String-Type
->DateType
转换,例如 @kamil-sindi。
但还有一个事实是,在读取 JSON 时,Spark 将 LongType
分配给所有数值。因此,我的 Parquet 将保存 LongType
个字段。
而 Spark 作业读取 Parquet,大概很难将 LongType
转换为 IntegerType
。
我在 S3 中有镶木地板数据,按 nyc_date 分区,格式为 s3://mybucket/mykey/nyc_date=Y-m-d/*.gz.parquet
。
我有一个 DateType 列 event_date
当我尝试使用 EMR 从 S3 读取并写入 hdfs 时出于某种原因抛出此错误。
from pyspark.sql import SparkSession
spark = SparkSession.builder.enableHiveSupport().getOrCreate()
df = spark.read.parquet('s3a://mybucket/mykey/')
df.limit(100).write.parquet('hdfs:///output/', compression='gzip')
错误:
java.lang.UnsupportedOperationException: org.apache.parquet.column.values.dictionary.PlainValuesDictionary$PlainBinaryDictionary
at org.apache.parquet.column.Dictionary.decodeToInt(Dictionary.java:48)
at org.apache.spark.sql.execution.vectorized.OnHeapColumnVector.getInt(OnHeapColumnVector.java:233)
at org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.GeneratedClass$GeneratedIterator.processNext(Unknown Source)
at org.apache.spark.sql.execution.BufferedRowIterator.hasNext(BufferedRowIterator.java:43)
at org.apache.spark.sql.execution.WholeStageCodegenExec$$anonfun$$anon.hasNext(WholeStageCodegenExec.scala:370)
at scala.collection.Iterator$$anon.hasNext(Iterator.scala:389)
at scala.collection.Iterator$$anon.hasNext(Iterator.scala:408)
at org.apache.spark.shuffle.sort.BypassMergeSortShuffleWriter.write(BypassMergeSortShuffleWriter.java:125)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:79)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:47)
at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:86)
at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:274)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1142)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:617)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
这是我得出的结论:
- 本地工作:-): 我在本地以相同的格式复制了一些数据,可以正常查询。
- 避免选择 event_date 有效 :-):选择所有 50 多列,但
event_date
不会导致任何错误。 - 显式读取路径抛出错误:-(: 将读取路径更改为
's3a://mybucket/mykey/*/*.gz.parquet'
仍然抛出错误。 - 指定模式仍然会引发错误:-(: 在加载之前指定模式仍然会导致相同的错误。
- 我可以将包括 eastern_date 在内的数据加载到数据仓库中:-)。
真的很奇怪,这只会导致 DateType 列出错。我没有任何其他 DateType 列。
使用 Spark 2.0.2 和 EMR 5.2.0。
我在写 parquet 时只是使用了 StringType 而不是 DateType。没有问题了。
我知道我迟到了...
我遇到了类似的问题。我读了几个 parquet 目录,将它们联合起来,并尝试编写。
我的解决方法是在写入之前添加一个 .select(...)。
当 Spark 读取从 JSON 文件生成的 Parquet 文件时,我遇到了这个异常。
TLDR: 如果可能,使用强制应用的预期模式重写输入 Parquet。
以下 Scala 代码。 Python不会有太大的不同。
这几乎就是我的 Parquet 一代最初的样子:
spark.read
.format("json")
.load("<path-to-json-file>.json")
.write
.parquet("<path-to-output-directory>")
但是读取上述 Parquet 的 Spark 作业正在对输入强制执行模式。大概是这样的:
val structType: StructType = StructType(fields = Seq(...))
spark.read.schema(structType)
以上是异常发生的地方。
修复: 为了修复异常,我不得不将模式强制应用于我生成的数据:
spark.read
.schema(structType) // <===
.format("json")
.load("<path-to-json-file>.json")
.write
.parquet("<path-to-output-directory>")
据我了解,在我的案例中出现异常的原因不(仅)是 String-Type
->DateType
转换,例如 @kamil-sindi。
但还有一个事实是,在读取 JSON 时,Spark 将 LongType
分配给所有数值。因此,我的 Parquet 将保存 LongType
个字段。
而 Spark 作业读取 Parquet,大概很难将 LongType
转换为 IntegerType
。