bash 并行循环
bash loop in parallel
我正在尝试 运行 并行执行此脚本,因为每组中的 i<=4。 runspr.py
本身是并行的,这很好。我想做的是 运行ning 在任何情况下都只有 4 个循环。
在我现在的代码中,它将 运行 一切。
#!bin/bash
for i in *
do
if [[ -d $i ]]; then
echo "$i id dir"
cd $i
python3 ~/bin/runspr.py SCF &
cd ..
else
echo "$i nont dir"
fi
done
我关注了https://www.biostars.org/p/63816/ and https://unix.stackexchange.com/questions/35416/four-tasks-in-parallel-how-do-i-do-that
但无法并行实现代码。
您不需要使用 for
循环。您可以像这样使用 gnu parallel
和 find
:
find . -mindepth 1 -maxdepth 1 -type d ! -print0 |
parallel -0 --jobs 4 'cd {}; python3 ~/bin/runspr.py SCF'
另一种可能的解决方案是:
find . -mindepth 1 -maxdepth 1 -type d ! -print0 |
xargs -I {} -P 4 sh -c 'cd {}; python3 ~/bin/runspr.py SCF'
我正在尝试 运行 并行执行此脚本,因为每组中的 i<=4。 runspr.py
本身是并行的,这很好。我想做的是 运行ning 在任何情况下都只有 4 个循环。
在我现在的代码中,它将 运行 一切。
#!bin/bash
for i in *
do
if [[ -d $i ]]; then
echo "$i id dir"
cd $i
python3 ~/bin/runspr.py SCF &
cd ..
else
echo "$i nont dir"
fi
done
我关注了https://www.biostars.org/p/63816/ and https://unix.stackexchange.com/questions/35416/four-tasks-in-parallel-how-do-i-do-that 但无法并行实现代码。
您不需要使用 for
循环。您可以像这样使用 gnu parallel
和 find
:
find . -mindepth 1 -maxdepth 1 -type d ! -print0 |
parallel -0 --jobs 4 'cd {}; python3 ~/bin/runspr.py SCF'
另一种可能的解决方案是:
find . -mindepth 1 -maxdepth 1 -type d ! -print0 |
xargs -I {} -P 4 sh -c 'cd {}; python3 ~/bin/runspr.py SCF'