GLM 返回阈值负值（截止）（在 R 中）

Question

我正在使用 GLM 进行物种分布建模。我有来自 GBIF (http://www.gbif.org/species/5846514) and bioclimatic data from Worldclim (http://worldclim.org/current) 的 Caiman crocodilus 物种的（南美）数据。我试图运行 GLM 以模拟物种分布（使用 dismo 包）：

modelGLM = pres ~ bioclim_10 + bioclim_11+ bioclim_16 + I(bioclim_16^2) + bioclim_17
GLM <- glm(modelGLM, family=binomial(link=logit), data=PresBackTrainRaw)
projecaoSuitability = predict(predictors, GLM, type='response')

到这里为止，一切看起来都很好，但是当我尝试获取阈值（截止）时，返回负值：

library(dismo)
> evaluation=evaluate(p=presencesTest,a=backgroundTest,m=GLM,x=predictors)
> thresholdValues=threshold(evaluation,'spec_sens')  
> thresholdValues    
> [1] -2.578797

由于 glm 输出（type='response'）的范围从 0 到 1，负阈值没有意义。谁能帮我看看哪里出了问题？

Answer 1

解决方案（user20650提供）：

在evaluate中添加type='response'：

library(dismo) evaluation=evaluate(p=presencesTest,a=backgroundTest,m=GLM,x=predictors,type='response') thresholdValues=threshold(evaluation,'spec_sens')
thresholdValues
[1] 0.07042211

GLM 返回阈值负值（截止）（在 R 中）

GLM returning negative value for threshold (cut-off)(in R)

r

glm

dismo