R中的伽玛分布下限

Question

我想将伽马分布拟合到由 338 个元素组成的数据集，具有固定的低阈值（我使用的是 R）。为了表示下限，我想使用具有三个参数的伽玛，添加位置。这是我的代码：

library(FAdist)
library(fitdistrplus)
fit <- fitdist(mydata,"gamma3",start=list(1,1,mythreshold))

每次我运行代码，我得到同样的错误：

<simpleError in optim(par = vstart, fn = fnobj, fix.arg = fix.arg, obs = data,     gr = gradient, ddistnam = ddistname, hessian = TRUE, method = meth,     lower = lower, upper = upper, ...): non-finite finite-difference value [3]>
Error in fitdist(Hs, "gamma3", start = list(1, 1, 3)) : 
  the function mle failed to estimate the parameters, 
                with the error code 100

所以我尝试更改起始值，使用通过具有两个参数的伽玛拟合获得的值，结果如下：

fit <- fitdist(mydata,"gamma")
fit
Fitting of the distribution ' gamma ' by maximum likelihood 
Parameters:
       estimate Std. Error
shape 21.417503  1.6348313
rate   5.352422  0.4133735

但它仍然不起作用..如果连带两个参数的伽马都不起作用我会理解，但事实并非如此，我无法给自己一个解释。此外，具有两个参数的 gamma 的 QQ 图和 ecdf 不太好......但是如果我拟合原始数据集上的分布，根据低阈值进行缩放，则拟合看起来很完美：

fit <- fitdist(mydata-mythreshold,"gamma")
fit
Fitting of the distribution ' gamma ' by maximum likelihood 
Parameters:
      estimate Std. Error
shape 1.059540 0.07212832
rate  1.058007 0.09117620

但是我不知道这样做是否正确...参数非常不同，我需要它们来计算与我的数据相关的 return 周期！这就是为什么我想到了带有位置参数的伽玛。

p.s。我没有附上数据，因为它们太多了，但我可以报告它们的摘要：

 summary(mydata)
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  3.003   3.282   3.753   4.001   4.444   8.087

Answer 1

建立一个可重现的例子；

library(FAdist); library(fitdistrplus)
set.seed(101)
x <- rgamma3(1000,shape=1,scale=1,thres=1)

对于大于数据集中最小值的阈值参数值，可能性是无限的（因为这些值应该是 impossible/have 截断分布下的零值）。我们可以通过为此参数设置上限来使事情正常进行：

fitdist(x,dgamma3,start=list(shape=1,scale=1,thres=0.5),
        upper=c(Inf,Inf,min(x)))
## Fitting of the distribution ' gamma3 ' by maximum likelihood 
## Parameters:
##        estimate Std. Error
## shape 0.9321949         NA
## scale 1.0586079         NA
## thres 1.0000012         NA

注意（1）在最大似然下，这种阈值参数总是以它能取的最大值结束（即数据集中的最小值）； (2) 标准误差是 NA 因为当参数达到边界时无法计算 Wald 标准误差。

或者，您可以通过定义包装函数来修复阈值参数：

dgconstr <- function(x,shape,scale,...) {
    dgamma3(x,shape,scale,thres=0.5,...)
}
pgconstr <- function(...) {
    pgamma3(...,thres=0.5)
}

fitdist(x,dgconstr,start=list(shape=1,scale=1))

R中的伽玛分布下限

gamma distribution lower limit in R

r

threshold

gamma-distribution

fitdistrplus