如何使用 scipy.io.savemat 附加到 .mat 文件？

Question

所以当我使用 savemat 命令时，它往往会覆盖文件。有没有可能的方法来追加而不是覆盖？我知道解决方法是将所有内容放入列表中，然后将其转换为字典。这对我不起作用，因为我正在努力提高 RAM 效率。在网上搜索我发现了这个 How NOT to overwrite the .mat file when using scipy.io.savemat()?

这也行不通，因为它涉及到在您的 ram 内存中提取一个数据文件以在每个循环中附加它，从速度的角度来看这似乎很愚蠢。

我考虑过附加到一个 numpy 二进制文件，然后将其拉入并保存到 .mat 文件？我不确定这是否比第一个选项更有效。

谢谢！

Answer 1

根据 savemat 文档：

file_name : str or file-like object

所以你可以以附加模式打开文件，然后写入，例如

io.savemat('temp.mat',{'data':np.ones(10)})  # write
with open('temp.mat','ab') as f:
    io.savemat(f, {'newdata':np.arange(5)})   # append
print io.loadmat('temp.mat').keys()           # read
# dict_keys(['data', '__globals__', 'newdata', '__header__', '__version__'])

或完整描述：

{'data': array([[ 1.,  1.,  1.,  1.,  1.,  1.,  1.,  1.,  1.,  1.]]),
 '__globals__': [],
 'newdata': array([[0, 1, 2, 3, 4]]),
 '__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file Platform: posix, Created on: Fri Mar 13 14:14:33 2015',
 '__version__': '1.0'}

https://github.com/scipy/scipy/blob/master/scipy/io/matlab/mio5.py#L34 中的注释表明当数据文件中有函数时追加会出现问题，但这表明如果我们只是保存数组则追加不是问题。但也许需要进一步搜索 scipy 问题。

Answer 2

它只适用于一次追加！如果追加两次，Matlab 会报错"File might be currupt"。

scipy.io.savemat('temp.mat',{'data':np.ones(10)})  # write
with open('temp.mat','ab') as f:
    scipy.io.savemat(f, {'newdata1':np.arange(5)})   # append
with open('temp.mat','ab') as f:
   scipy.io.savemat(f, {'newdata2':np.arange(5)})   # append

Answer 3

如果您需要附加大量数据，另一个选项是下一个：

self.upload1 = sio.loadmat(self.namedir,self.params)
sio.savemat('params_lo.mat', self.upload1)

使用此表单加载数据并添加新变量。要小心，因为如果它们具有相同的名称，则不会更改其值。因此，为了更正此问题，我删除了所有要更改的变量。

    self.upload = sio.loadmat(self.namedir)
    for i in self.str_vars:
       try:
          del self.upload[i]
       except:
          continue
    sio.savemat('params_lo.mat', self.upload)
    self.upload1 = sio.loadmat(self.namedir,self.params)
    sio.savemat('params_lo.mat', self.upload1)

如何使用 scipy.io.savemat 附加到 .mat 文件？

How to append to .mat file using scipy.io.savemat?

python

numpy

scipy