openmpi ignored error: mca interface is not recognized

Question

今天早上我升级了我的 gfort运行（从 4.7 到 6.1.0）和 OpenMPI（从 1.10 到 2.0.1）编译器。我写了这个简单的程序：

program main                                                                                             
    use mpi_f08                                                                                          
    implicit none                                                                                        
    integer :: ierror                                                                                    

    call mpi_init(ierror)                                                                                
    call mpi_finalize(ierror)                                                                            
end program main

当我直接编译时（没有 mpirun，只有 ./a.out），我得到以下消息（它们不是真正的错误，因为程序按预期运行）：

[username:79762] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex
  Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so
  Expected in: flat namespace
 in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored)
[username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex
  Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so
  Expected in: flat namespace
 in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored)
[username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_pml_bfo: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so, 9): Symbol not found: _ompi_free_list_item_t_class
  Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so
  Expected in: flat namespace
 in /usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so (ignored)
[username:79761] mca_base_component_repository_open: coll "/usr/local/lib/openmpi/mca_coll_hierarch" uses an MCA interface that is not recognized (component MCA v2.0.0 != supported MCA v2.1.0) -- ignored
[username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_coll_ml: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so, 9): Symbol not found: _mca_bcol_base_components_in_use
  Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so
  Expected in: flat namespace
 in /usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so (ignored)

我记得在使用 openmpi 和运行使用 mpich 或 intel 版本的 mpirun 编译我的代码时收到了类似的警告。现在显然不是这种情况，但我想我会提到它。

知道是什么原因导致这些警告吗？

编辑：

为了确保我的运行时 OpenMPI 库确实是 2.0.1，我将这行代码添加到上面显示的代码中：

print'(3(A,I1))', "OpenMPI version = ", OMPI_MAJOR_VERSION, ".", OMPI_MINOR_VERSION, ".",& 
  8                       OMPI_RELEASE_VERSION

给出了以下输出：

OpenMPI version = 2.0.1

按照 VladimirF 的建议，我运行 mpirun -v 输出了以下内容：

 [username:02210] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex
  Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so
  Expected in: flat namespace
 in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored)
--------------------------------------------------------------------------
No executable was specified on the mpirun command line.

Aborting.

此外，mpirun --version returns：mpirun (Open MPI) 2.0.1

Answer 1

感谢 Gilles Gouaillardet 在 OpenMPI 论坛上的帮助，我已经解决了这个问题。

问题：

我安装了较新的版本 2.0.1 而没有卸载 1.10。由于我将它安装在同一位置，一些 mca 文件被覆盖，而其他文件在较新版本中已被删除或重命名，因此仍然存在于目录中。最终，这些模块文件无法被2.0.1版本识别，导致出现上述警告。

解法：

删除所有插件文件：rm -rf /usr/local/lib/openmpi
重新安装 Openmpi：make install

openmpi ignored error: mca interface is not recognized

openmpi ignored error: mca interface is not recognized

macos

fortran

mpi

gfortran

openmpi