PyCUDA 未对齐地址清理失败

Question

我是 CUDA 编程的新手，正在从 PyCUDA 开始学习基础知识。我研究了教程并获得了运行几个简单的测试代码。测试仅使用一维数组。当我尝试使用二维数组运行以下代码时，我不断收到 PyCUDA 警告，指出由于地址未对齐导致清理操作失败。

import pycuda.autoinit
import pycuda.driver as drv
import numpy as np
from pycuda.compiler import SourceModule

mod = SourceModule("""
    __global__ void multiply(float **dest) {
        const int i = threadIdx.x;
        const int j = threadIdx.y;
        dest[i][j] = 2.0*dest[i][j];
    }
""")

a = np.random.randn(32, 32).astype(np.float32)
multiply = mod.get_function("multiply")
multiply(drv.InOut(a), block=(32,32,1), grid=(1,1))

print(a)

我在运行上述脚本时得到的错误是：

Traceback (most recent call last):
  File "cudaTest.py", line 16, in <module>
    multiply(drv.InOut(a), block=(32,32,1), grid=(1,1))
  File "/users/gpu/local/python3.3/lib/python3.6/site-packages/pycuda-2016.1.2-py3.6-linux-x86_64.egg/pycuda/driver.py", line 405, in function_call
    Context.synchronize()
pycuda._driver.LogicError: cuCtxSynchronize failed: misaligned address
PyCUDA WARNING: a clean-up operation failed (dead context maybe?)
cuMemFree failed: misaligned address
PyCUDA WARNING: a clean-up operation failed (dead context maybe?)
cuModuleUnload failed: misaligned address

我已经检查了关于 SO 的其他问题并找到了 similar one。按照那里给出的答案，我尝试指定数组的大小 a，但无济于事。

我运行在一个有两个 nVidia Tesla K10 GPU 的集群上执行此操作。由于我没有 root 访问权限，我不得不在本地安装 Python3 并将 numpy、pyCUDA 等添加到本地安装。 Ubuntu 12.04.1 LTS 上的集群运行s。我正在使用 Python 3.6.0 与 PyCUDA 2016.1.2 和 CUDA 6.0

Answer 1

这里的问题是你对什么是“二维数组”的理解不正确。默认情况下，Numpy 数组（以及 PyCUDA gpuarrays 的扩展名）按行主要顺序存储在倾斜的线性内存中。您的内核已被编写为期望输入中的指针数组，并试图使用浮点数据作为地址，从而导致您看到的运行时寻址错误。

要更正内核以使用数组，您需要将其修改为：

mod = SourceModule("""
    __global__ void multiply(float *dest, int lda) {
        const int i = threadIdx.x;
        const int j = threadIdx.y;
        float *p = &dest[i * lda + j]; // row major order
        *p *= 2.0f;
    }
""")

请注意，数组作为指向倾斜线性分配的指针传递，而不是行指针数组。因此，您还需要将元素中数组的间距传递给内核，以便调用 PyCUDA 主机代码如下所示：

N = 8
a = np.random.randn(N, N).astype(np.float32)
print(a)
multiply = mod.get_function("multiply")
lda = np.int32(N)
multiply(drv.InOut(a), lda, block=(N,N,1), grid=(1,1))
print(a)

您应该会发现现在可以正常工作了。

PyCUDA 未对齐地址清理失败

PyCUDA misaligned address cleanup failure

python

python-3.x

cuda

pycuda