从未来调用闪亮的 JavaScript 回调

Calling a shiny JavaScript Callback from within a future

在 shiny 中,可以从服务器逻辑调用 javascript 中编写的客户端回调。在 ui.R 中说你有一些 JavaScript 包括一个名为 setText:

的函数
tags$script('
    Shiny.addCustomMessageHandler("setText", function(text) {
        document.getElementById("output").innerHTML = text;
    })          
')

然后在您的 server.R 中您可以调用 session$sendCustomMessage(type='foo', 'foo')

假设我有一个 long-运行ning 函数,其中 returns 一些数据要绘制。如果我正常执行此操作,R 线程在 运行 执行此函数时会很忙,因此此时无法处理其他请求。能够使用 futures 包 运行 这个函数真的很有用,这样它 运行 就可以异步到代码,并异步调用回调。但是,当我尝试时,这似乎不起作用。

抱歉,如果这不是很清楚。作为一个简单的示例,在您取消注释试图在 server.R 中调用 future 的两行之前,以下内容应该有效。一旦这些行被取消注释,回调就永远不会被调用。显然它在这个例子的上下文中实际上没有用,但我认为它在一般情况下会非常有用。

ui.R:

library(shiny)
shinyUI(fluidPage(
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
       sliderInput("max",
                   "Max random number:",
                   min = 1,
                   max = 50,
                   value = 30)
    ),
    mainPanel(
       verbatimTextOutput('output'),
       plotOutput('plot')
    )
  ),
  tags$script('
    Shiny.addCustomMessageHandler("setText", function(text) {
        document.getElementById("output").innerHTML = text;
    })          
  ')
))

server.R:

library(shiny)
library(future)
plan(multiprocess)
shinyServer(function(input, output, session) {
    output$plot <- reactive({
      max <- input$max
      #f <- future({
        session$sendCustomMessage(type='setText', 'Please wait')
        Sys.sleep(3)
        x <- runif(1,0,max)
        session$sendCustomMessage(type='setText', paste('Your random number is', x))
        return(NULL)
      #})
    })
})

一个 诚然 复杂的解决方法是在 Shiny 应用程序中对 R 的 single-threaded 性质进行以下操作:

  1. 分离外部 R 进程(运行 另一个 R 脚本位于 闪亮的应用程序目录,或可从中访问的任何目录 R 中的 Shiny session) (我以前试过这种分裂, 并且有效)。
  2. 配置该脚本以将其结果输出到临时目录(假设您在 Unix-based 系统上 运行ning Shiny)并为输出文件指定一个唯一的文件名(最好在当前 session 的命名空间(即“/tmp/[SHINY SESSION HASH ID]_example_output_file.RData”。
  3. 使用 Shiny 的 invalidateLater() 函数检查输出文件是否存在。
  4. 将输出文件加载到 Shiny session 工作区。
  5. 最后,通过删除加载后生成的输出文件进行垃圾收集。

希望对您有所帮助。

这是一个关于如何在闪亮的应用程序中使用未来包的解决方案。 当 运行 计算密集型任务或等待 sql 查询完成时,可能有多个会话没有会话阻塞另一个会话。我建议打开两个会话(只需在两个选项卡中打开 http://127.0.0.1:14072/)并使用按钮来测试功能。

run_app.R:

library(shiny)
library(future)
library(shinyjs)

runApp(host = "127.0.0.1", port = 14072, launch.browser = TRUE)

ui.R:

ui <- fluidPage(
            useShinyjs(),
            textOutput("existsFutureData"),
            numericInput("duration", "Duration", value = 5, min = 0),
            actionButton("start_proc", h5("get data")),
            actionButton("start_proc_future", h5("get data using future")),
            checkboxInput("checkbox_syssleep", label = "Use Sys.sleep", value = FALSE),
            h5('Table data'),
            dataTableOutput('tableData'),
            h5('Table future data'),
            dataTableOutput('tableFutureData')
)

server.R:

plan(multiprocess) 

fakeDataProcessing <- function(duration, sys_sleep = FALSE) {
  if(sys_sleep) {
    Sys.sleep(duration)
    } else {
    current_time <- Sys.time()
    while (current_time + duration > Sys.time()) {  }
  }
  return(data.frame(test = Sys.time()))
}
#fakeDataProcessing(5)
############################ SERVER ############################ 
server <- function(input, output, session) { 
  values <- reactiveValues(runFutureData = FALSE, futureDataLoaded = 0L)
  future.env <- new.env()

  output$existsFutureData <- renderText({ paste0("exists(futureData): ", exists("futureData", envir = future.env)," | futureDataLoaded: ", values$futureDataLoaded) })

  get_data <- reactive({
  if (input$start_proc > 0) {
    shinyjs::disable("start_proc")
    isolate({ data <- fakeDataProcessing(input$duration) })
    shinyjs::enable("start_proc")
    data
  }
})

  observeEvent(input$start_proc_future, { 
      shinyjs::disable("start_proc_future")
      duration <- input$duration # This variable needs to be created for use in future object. When using fakeDataProcessing(input$duration) an error occurs: 'Warning: Error in : Operation not allowed without an active reactive context.'
      checkbox_syssleep <- input$checkbox_syssleep
      future.env$futureData %<-% fakeDataProcessing(duration, sys_sleep = checkbox_syssleep)
      future.env$futureDataObj <- futureOf(future.env$futureData)
      values$runFutureData <- TRUE
      check_if_future_data_is_loaded$resume()
      },
    ignoreNULL = TRUE, 
    ignoreInit = TRUE
  )

  check_if_future_data_is_loaded <- observe({
      invalidateLater(1000)
      if (resolved(future.env$futureDataObj)) {
          check_if_future_data_is_loaded$suspend()
          values$futureDataLoaded <- values$futureDataLoaded + 1L
          values$runFutureData <- FALSE
          shinyjs::enable("start_proc_future")
      }
  }, suspended = TRUE)

  get_futureData <- reactive({ if(values$futureDataLoaded > 0) future.env$futureData })

  output$tableData <- renderDataTable(get_data())

  output$tableFutureData <- renderDataTable(get_futureData())

  session$onSessionEnded(function() {
    check_if_future_data_is_loaded$suspend()
  })
}

我改造了 André le Blond 的 to and made a gist showing a generic asynchronous task processor which can be used either by itself or with Shiny: FutureTaskProcessor.R

注意它包含两个文件:FutureProcessor.R which is the stand alone asynchronous task handler and app.R 这是一个 Shiny 应用程序,展示了 Shiny 中异步处理程序的使用。