ImageJ，roiManager（"add"）

Question

这是我在 Whosebug 中的第一个问题。

我对roiManager("add")宏命令有疑问。我试图在插件中插入一个宏内容，但我试图了解什么是 adding 到 roi 管理器。这是代码：

run("Analyze Particles...", "size=0-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Masks display clear record");

for (i=0; i<nResults; i++){
x = getResult('XStart', i);
    y = getResult('YStart', i);
    doWand(x,y);
    roiManager("add");
}

我不确定 roiManager("add") 是否正在插入 "doWand" 结果或其他东西。

如果有人帮助我，我将不胜感激。谢谢

编辑： 现在我正在尝试使用 Java classes 开发宏，但我不确定如何使用 RoiManager class 将粒子添加到 roi 管理器。我把代码放在这里：

ij.plugin.frame.RoiManager roiManager = ij.plugin.frame.RoiManager.getInstance();
IJ.run("Convert to Mask");
IJ.run("Fill Holes");
IJ.run("Set Scale...", "distance=1 known="+pixelSize+" pixel=1 unit=um");
IJ.run("Analyze Particles...", "size=0-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Masks display clear record");
// add the particles to the roiManager
ResultsTable rt = Analyzer.getResultsTable();
int nResults = rt.getCounter();
for (int i=0; i<nResults; i++) {
    int x = Integer.parseInt(rt.getStringValue("XStart", i));
    int y = Integer.parseInt(rt.getStringValue("YStart", i));
    int doWandResult = IJ.doWand(x,y);

    //roiManager.add(IJ.getImage(), Roi¿?, doWandResult); //¿?¿?¿?¿?¿
}

Answer 1

如果您只想将 Analyze Particles 的结果添加到 ROI Manager，请使用选项 Add to Manager：

run("Analyze Particles...", "add");

否则，您可以按照您的建议添加单个 ROI，使用：

宏语言

roiManager(add) 将当前选择添加到 the ROI Manager，就像您使用 编辑 > 选择 > 添加到管理器一样。

在您的宏中，这意味着 doWand(x,y) 创建的选择被添加到 ROI 管理器。

另见 macro language documentation。

一个Java插件:

我推荐使用Recorder（插件>宏>记录...）在Java模式以获取所需的代码。在插件中，您可以使用例如：

IJ.run(imp, "Analyze Particles...", "add");

或

import ij.plugin.frame.RoiManager;

...

RoiManager rm = RoiManager.getInstance();
rm.addRoi(imp.getRoi());

另见 RoiManager javadoc。

ImageJ，roiManager（"add"）

ImageJ, roiManager("add")

java

macros

imagej