R: pi[[j]] 中的错误：下标越界——数据帧列表上的 rbind

Question

我正在尝试将由 lapply 复杂函数生成的大型数据帧列表 (outputDfList) 绑定到大型 table。您可以通过以下方式重新创建 outputDfList：

df1=data.frame("randomseq_chr15q22.1_translocationOrInsertion", "chr15", "63126742")
names(df1)=NULL
df2=df1=data.frame("chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion", "chr18 ", "63126741")
names(df2)=NULL
outputDfList=list(df1,df2)

我的密码是

do.call(rbind, outputDfList)

我收到的错误信息：

Error in pi[[j]] : subscript out of bounds

我仔细检查了每个数据帧的列号，它们都是一样的。我还尝试使用 "options(error=recover)" 进行调试，但我对它的熟悉程度不足以解决确切的问题。任何帮助表示赞赏。谢谢。

Answer 1

更新后您的问题似乎是列名无效：数据框列名必须是 non-null.

更正此后，代码即可运行：

for (i in seq_along(outputDfList)) {
    colnames(outputDfList[[i]]) = paste0('V', seq_len(ncol(outputDfList[[i]])))
}

do.call(rbind, outputDfList)
#                                       V1     V2       V3
# 1 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18  63126741
# 2 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18  63126741

但是，我很困惑这种情况最初是怎么发生的。此外，我在您的代码中收到的错误消息 still 与您的不同：

Error in match.names(clabs, names(xi)) :
names do not match previous names

R: pi[[j]] 中的错误：下标越界——数据帧列表上的 rbind

R: Error in pi[[j]] : subscript out of bounds -- rbind on a list of dataframes

r

list

dataframe

rbind

do.call