在 Python 2.7 中使用 Ruffus 库，just_print 标志失败

Question

我在 Python 2.7 中有一个 ruffus 管道，但是当我用 -n 或 --just_print 调用它时，它仍然运行所有实际任务，而不仅仅是打印管道就像它应该的那样。我：
* 没有 -n 参数会取代内置参数（尽管我有其他命令行参数）
* 有一堆带有 @transform() 或 @merge() 装饰器的函数
* 使用 run_pipeline() 调用

结束管道

有没有其他人遇到过这个问题？非常感谢！

Answer 1

从 ruffus 2.4 版开始，您可以使用内置的 ruffus.cmdline，它通过使用 argparse 的 cmdline.py 模块存储适当的标志，例如：

from ruffus import *
parser = cmdline.get_argparse(description='Example pipeline')
options = parser.parse_args()

@originate("test_out.txt")
def run_testFunction(output):
        with open(output,"w") as f:
            f.write("it's working!\n")

cmdline.run(options)

然后运行从终端使用如下命令的管道：

python script.py --verbose 6 --target_tasks run_testFunction --just_print

如果您想手动执行此操作（这对于旧版本的 ruffus 是必需的），您可以使用 argparse 调用 pipeline_printout() rather than pipeline_run()，以便 --just_print 标志导致适当调用，例如：

from ruffus import *
import argparse
import sys

parser = argparse.ArgumentParser(description='Example pipeline')
parser.add_argument('--just_print', dest='feature', action='store_true')
parser.set_defaults(feature=False)
args = parser.parse_args()

@originate("test_out.txt")
def run_testFunction(output):
        with open(output,"w") as f:
            f.write("it's working!\n")

if args.feature:
    pipeline_printout(sys.stdout, run_testFunction, verbose = 6)
else:
    pipeline_run(run_testFunction, verbose = 6)

然后您将运行命令如下：

python script.py --just_print

在 Python 2.7 中使用 Ruffus 库，just_print 标志失败

Using Ruffus library in Python 2.7, just_print flag fails

python

pipeline

python-2.7

ruffus