如何在 ComplexHeatmap 包中制作颜色边框

Question

在 ComplexHeatmap 包中，我找不到在热图周围绘制边框的方法。我已经在附图中说明了这个问题。任何人都可以帮我这样做吗？提前致谢！

示例代码：

library(ComplexHeatmap)
library(circlize)

set.seed(123)
mat = matrix(rnorm(80, 2), 8, 10)
mat = rbind(mat, matrix(rnorm(40, -2), 4, 10))
rownames(mat) = paste0("R", 1:12)
colnames(mat) = paste0("C", 1:10)
#plot
Heatmap(mat, cluster_rows = F, cluster_columns = F, show_heatmap_legend = FALSE)

带边框的示例图片。

Answer 1

我收到了作者的邮件回复

mat = matrix(rnorm(100), 10)

Heatmap(mat, name  = "foo")

decorate_heatmap_body("foo", {

    grid.rect(gp = gpar(fill = "transparent", col = "black", lwd = 2))

})

在decorate_heatmap_body()中，第一个参数是热图

的"name"

您需要在 Heatmap() 中定义。

如何在 ComplexHeatmap 包中制作颜色边框

How to make color border in ComplexHeatmap package

r

heatmap