如何在 matplotlib 中隐藏曲面图后面的一条线？

Question

我想使用 Matplotlib 通过球体表面的颜色图绘制数据。此外，我想添加一个 3D 线图。到目前为止我的代码是这样的：

import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import numpy as np


NPoints_Phi         = 30
NPoints_Theta       = 30

radius              = 1
pi                  = np.pi
cos                 = np.cos
sin                 = np.sin

phi_array           = ((np.linspace(0, 1, NPoints_Phi))**1) * 2*pi
theta_array         = (np.linspace(0, 1, NPoints_Theta) **1) * pi


phi, theta          = np.meshgrid(phi_array, theta_array) 


x_coord             = radius*sin(theta)*cos(phi)
y_coord             = radius*sin(theta)*sin(phi)
z_coord             = radius*cos(theta)


#Make colormap the fourth dimension
color_dimension     = x_coord 
minn, maxx          = color_dimension.min(), color_dimension.max()
norm                = matplotlib.colors.Normalize(minn, maxx)
m                   = plt.cm.ScalarMappable(norm=norm, cmap='jet')
m.set_array([])
fcolors             = m.to_rgba(color_dimension)



theta2              = np.linspace(-np.pi,  0, 1000)
phi2                = np.linspace( 0 ,  5 * 2*np.pi , 1000)


x_coord_2           = radius * np.sin(theta2) * np.cos(phi2)
y_coord_2           = radius * np.sin(theta2) * np.sin(phi2)
z_coord_2           = radius * np.cos(theta2)

# plot
fig                 = plt.figure()

ax                  = fig.gca(projection='3d')
ax.plot(x_coord_2, y_coord_2, z_coord_2,'k|-', linewidth=1 )
ax.plot_surface(x_coord,y_coord,z_coord, rstride=1, cstride=1, facecolors=fcolors, vmin=minn, vmax=maxx, shade=False)
fig.show()

此代码生成的图像如下所示：这几乎是我想要的。但是，黑线在背景中时应被曲面图遮挡，而在前景中时应可见。换句话说，黑线不应该 "shine through" 球体。

这可以在 Matplotlib 中完成而不使用 Mayavi 吗？

Answer 1

问题是 matplotlib 不是光线追踪器，它并不是真正设计为具有 3D 功能的绘图库。因此，它与 2D space 中的层系统一起工作，并且对象可以在更前面或更后面的层中。这可以用大多数绘图函数的 zorder 关键字参数来设置。然而，matplotlib 并不知道一个对象在 3D 中是在另一个对象的前面还是后面 space。因此，您可以使完整的线可见（在球体前面）或隐藏（在球体后面）。

解决方案是自己计算应该可见的点。我在这里说的是点，因为一条线将连接可见点"through"球体，这是不需要的。因此，我将自己限制在绘制点上——但如果你有足够多的点，它们看起来就像一条线 :-)。或者，可以通过在不连接的点之间使用额外的 nan 坐标来隐藏线；我将自己限制在此处，以免使解决方案变得比需要的更复杂。

对于完美球体来说，计算哪些点应该可见并不难，思路如下：

获取3D图的视角
据此，在视图方向的数据坐标中计算视线平面的法向量。
计算此法向量（在下面的代码中称为X）与线点之间的标量积，以便使用此标量积作为是否显示点的条件。如果标量积小于 0，则从观察者的角度来看，相应的点位于观察平面的另一侧，因此不应显示。
按条件筛选点。

然后，另一个可选任务是针对用户旋转视图的情况调整显示的点。这是通过将 motion_notify_event 连接到使用上述过程根据新设置的视角更新数据的函数来实现的。

请参阅下面的代码了解如何实现它。

import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import numpy as np


NPoints_Phi         = 30
NPoints_Theta       = 30

phi_array           = ((np.linspace(0, 1, NPoints_Phi))**1) * 2*np.pi
theta_array         = (np.linspace(0, 1, NPoints_Theta) **1) * np.pi

radius=1
phi, theta          = np.meshgrid(phi_array, theta_array) 

x_coord             = radius*np.sin(theta)*np.cos(phi)
y_coord             = radius*np.sin(theta)*np.sin(phi)
z_coord             = radius*np.cos(theta)

#Make colormap the fourth dimension
color_dimension     = x_coord 
minn, maxx          = color_dimension.min(), color_dimension.max()
norm                = matplotlib.colors.Normalize(minn, maxx)
m                   = plt.cm.ScalarMappable(norm=norm, cmap='jet')
m.set_array([])
fcolors             = m.to_rgba(color_dimension)

theta2              = np.linspace(-np.pi,  0, 1000)
phi2                = np.linspace( 0, 5 * 2*np.pi , 1000)

x_coord_2           = radius * np.sin(theta2) * np.cos(phi2)
y_coord_2           = radius * np.sin(theta2) * np.sin(phi2)
z_coord_2           = radius * np.cos(theta2)

# plot
fig = plt.figure()

ax = fig.gca(projection='3d')
# plot empty plot, with points (without a line)
points, = ax.plot([],[],[],'k.', markersize=5, alpha=0.9)
#set initial viewing angles
azimuth, elev = 75, 21
ax.view_init(elev, azimuth )

def plot_visible(azimuth, elev):
    #transform viewing angle to normal vector in data coordinates
    a = azimuth*np.pi/180. -np.pi
    e = elev*np.pi/180. - np.pi/2.
    X = [ np.sin(e) * np.cos(a),np.sin(e) * np.sin(a),np.cos(e)]  
    # concatenate coordinates
    Z = np.c_[x_coord_2, y_coord_2, z_coord_2]
    # calculate dot product 
    # the points where this is positive are to be shown
    cond = (np.dot(Z,X) >= 0)
    # filter points by the above condition
    x_c = x_coord_2[cond]
    y_c = y_coord_2[cond]
    z_c = z_coord_2[cond]
    # set the new data points
    points.set_data(x_c, y_c)
    points.set_3d_properties(z_c, zdir="z")
    fig.canvas.draw_idle()

plot_visible(azimuth, elev)
ax.plot_surface(x_coord,y_coord,z_coord, rstride=1, cstride=1, 
            facecolors=fcolors, vmin=minn, vmax=maxx, shade=False)

# in order to always show the correct points on the sphere, 
# the points to be shown must be recalculated one the viewing angle changes
# when the user rotates the plot
def rotate(event):
    if event.inaxes == ax:
        plot_visible(ax.azim, ax.elev)

c1 = fig.canvas.mpl_connect('motion_notify_event', rotate)

plt.show()

最后可能需要稍微调整一下 markersize、alpha 和点数，以便从中获得最具视觉吸引力的结果。

如何在 matplotlib 中隐藏曲面图后面的一条线？

How to obscure a line behind a surface plot in matplotlib?

python

plot

matplotlib

mayavi