igraph r 估计大型网络的网络中心性度量需要多长时间

Question

我有一个包含 300000 个节点和 800000 个边的网络。 R中的igraph包计算每个节点的网络中心性度量（包括紧密度和介数）需要多长时间。

Answer 1

介数和紧密度的运行时间都是二次方的，因此随着节点数量的增加而显着增加。 These authors 估计需要 7,000 秒来计算具有 325,000 条边的图形的介数。具有 800,000 个边的图形将花费更长的时间。

igraph 确实有针对大图的特定函数 - estimate_betweenness 和 estimate_closeness，手册上说它们在运行时不是二次函数。您定义一个截止值，这是将包含在计算中的最大路径长度。传统上，介数考虑任意长度的路径。定义截止时间大大减少了运行时间：

> lg <- erdos.renyi.game(300000,800000,type="gnm")
> ptm <- proc.time()
> igraph::estimate_betweenness(lg, cutoff = 3)[1:10]
 [1]  29  12  14  90  29  98  69  48 200  86
> proc.time() - ptm
   user  system elapsed 
 27.605   0.327  30.113

~ 30 秒。这是在 dual-core macbook air 上。随着截止时间的增加，运行时间也会增加。

当然，权衡是您拥有每个节点的介数分数的估计值，而不是直接计算。

参考：

Kang, U.、Papadimitriou, S.、Sun, J. 和 Tong, H.（2011 年 4 月）。大型网络中的中心性：算法和观察。在 2011 年 SIAM 国际数据挖掘会议论文集（第 119-130 页）中。工业和应用数学学会。 Link

igraph r 估计大型网络的网络中心性度量需要多长时间

how long does it take for igraph r to estimate network centrality measures for a large network

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参考：