带有复合键的 Numpy 数组;在两者中找到子集

Numpy arrays with compound keys; find subset in both

我有两个 2D numpy 数组形状:

(19133L, 12L)
(248L, 6L)

在每种情况下,前 3 个字段构成一个标识符。

我想缩小较大的矩阵,使其仅包含具有第二个矩阵中也存在的标识符的行。所以形状应该是(248L,12L)。我该怎么做?

然后我想对它进行排序,以便按第一个值、第二个值和第三个值对数组进行索引,以便 (3 3 4) 出现在 (3 3 5) 等之后。是否有多字段排序功能?

编辑:

我试过了pandas:

df1 = DataFrame(arr1.astype(str))
df2 = DataFrame(arr2.astype(str))

df1.set_index([0,1,2])
df2.set_index([0,1,2])

out = merge(df1,df2,how="inner") 
print(out.shape)

但这导致 (0,13) 形状

使用pandas.

pandas.set_index() 允许多个键。因此,将索引设置为前三列(使用 drop=False, inplace=True)以避免不必要地改变或复制数据框。

然后,merge(...how='inner') 与您的数据帧相交。

一般来说,对于任意数据帧操作,numpy 很快就会失去动力;你的默认设置应该是尝试 pandas。性能也更高。