从 neo4j-driver 密码查询创建 iGraph

Question

我正在尝试做类似于的事情，但使用的是 neo4j-driver 而不是 py2neo。当我运行以下代码时，我得到了查询返回的所有节点的列表，但是 i graph 不创建任何节点。

from igraph import Graph
from neo4j.v1 import GraphDatabase, basic_auth

driver = GraphDatabase.driver("bolt://localhost:7687", auth=basic_auth("neo4j", "pass123"))
session = driver.session()

result = session.run("MATCH (a:author)-[r:PUBLISHED]->(p:paper) RETURN a,r,p")

for record in result:
  print(record)

g = Graph.TupleList(result)
print(g)
session.close()

控制台结果：

<Record a=<Node id=946 labels=set([u'author']) properties={u'name': u'a9', u'id': u'9'}> r=<Relationship id=950 start=946 end=955 type=u'PUBLISHED' properties={}> p=<Node id=955 labels=set([u'paper']) properties={u'year': 2009, u'id': u'9', u'name': u'p9'}>>
<Record a=<Node id=946 labels=set([u'author']) properties={u'name': u'a9', u'id': u'9'}> r=<Relationship id=949 start=946 end=953 type=u'PUBLISHED' properties={}> p=<Node id=953 labels=set([u'paper']) properties={u'year': 2007, u'id': u'7', u'name': u'p7'}>>
IGRAPH UN-- 0 0 --
+ attr: name (v)

有人能告诉我为什么这不起作用吗？

Answer 1

Py2neo 的 cypher.execute 方法 returns 本质上是字典列表（或命名元组）的对象。 neo4j 驱动程序没有。相反，您需要遍历 session.run 返回的游标对象并构造一个元组列表以传递给 igraph 构造函数。这里的示例使用来自 BuzzFeed Trumpworld graph 的数据，这恰好是我目前在 Neo4j 中拥有的数据，因此请根据您的需要调整查询：

from igraph import Graph
from neo4j.v1 import GraphDatabase, basic_auth

driver = GraphDatabase.driver("bolt://localhost:7687", auth=basic_auth("neo4j", "pass123"))
session = driver.session()

result = session.run("MATCH (p1:Person)-[r]->(p2:Person) RETURN p1.name AS name1, p2.name AS name2")
nodelist = []
for record in result:
    nodelist.append((record["name1"], record["name2"]))

nodelist 是一个元组列表，看起来像这样：

>>> print(nodelist)

[('RUDY GIULIANI', 'WILBUR ROSS'),
('GARY COHN', 'DONALD J. TRUMP'),
('DAN COATS', 'DONALD J. TRUMP'),
('MICHAEL POMPEO', 'DONALD J. TRUMP'),
('OMAROSÉ ONEE MANIGAULT', 'DONALD J. TRUMP'),
('MICK MULVANEY', 'DONALD J. TRUMP'),
('ALEX SHNAIDER', 'DONALD J. TRUMP'),
('MEHMET ALI YALCINDAG', 'DONALD J. TRUMP'),
('MANGAL PRABHAT LODHA', 'DONALD J. TRUMP'),
('ROGER KHAFIF', 'DONALD J. TRUMP')...

然后实例化一个igraph对象：

g = Graph.TupleList(nodelist)

我们可以运行此图上的 PageRank 并查看哪个节点具有最高的 PageRank 作为完整性检查：

pg = g.pagerank()
max_pg = max(pg)
[g.vs[idx]["name"] for idx, pg in enumerate(pg) if pg == max_pg]

结果是：

['DONALD J. TRUMP']

从 neo4j-driver 密码查询创建 iGraph

Creating an iGraph from a neo4j-driver cypher query

python

igraph

neo4j