模式匹配和选择打印数字
pattern matching and selecting digits for printing
我有一个文件,其中有一长行包含许多列,每列的 header 类似这样。
BMR_22@O15-BMR_1@O23-H23 BMR_14@O22-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O14-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O12-BMR_1@O16-H16 BMR_17@O26-BMR_2@O24-H24 BMS_88@O22-BMR_4@O22-H22 BMS_89@O22-BMR_4@O26-H26 BMS_89@O12-BMR_4@O12-H12 BMR_15@O25-BMR_15@O26-H26 BMS_96@O25-BMR_5@O16-H16 BMR_13@O23-BMR_6@O26-H26 BMR_27@O22-BMR_126@O12-H12 BMR_17@O26-BMR_6@O13-H13 BMR_26@O26-BMR_6@O16-H16 BMR_29@O26-BMR_7@O16-H16 BMS_86@O23-BMR_19@O26-H26 BMS_78@O16-BMR_9@O16-H16 BMS_96@O24-BMR_10@O23-H23 BMR_14@O25-BMR_11@O24-H24 BMS_90@O22-BMR_11@O26-H26 BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12 BMR_120@O24-BMR_11@O13-H13 BMR_25@O22-BMR_11@O13-H13 BMS_65@O24-BMR_12@O23-H23 BMR_31@O11-BMR_12@O12-H12
我想 select 基于某些条件的列。
如果使用如下命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile
我得到类似的东西:
BMR_1@O13-BMR_14@O13-H13
BMR_2@O13-BMR_16@O13-H13
BMR_6@O13-BMR_27@O23-H23
BMR_2@O13-BMR_16@O12-H12
BMR_1@O13-BMR_30@O26-H26
BMR_1@O13-BMR_11@O23-H23
BMR_1@O13-BMR_14@O22-H22
BMR_6@O13-BMR_27@O22-H22
如果我使用如下命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9][1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile
我得到如下输出:
BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12
BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12
BMR_17@O13-BMR_27@O13-H13
BMR_64@O13-BMR_39@O12-H12
BMR_58@O13-BMR_44@O16-H16
BMR_36@O13-BMR_61@O12-H12
BMR_36@O13-BMR_61@O13-H13
如果我想同时 select 单位数和双位数(比如 BMR_2@O13-BMR_16@O12 -H12 和 BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12) 在一个 运行 ?
您可以在单个 awk 命令中将重复指定为 1 次或 2 次,如下所示:
awk --posix 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]{1,2}@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile
我有一个文件,其中有一长行包含许多列,每列的 header 类似这样。
BMR_22@O15-BMR_1@O23-H23 BMR_14@O22-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O14-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O12-BMR_1@O16-H16 BMR_17@O26-BMR_2@O24-H24 BMS_88@O22-BMR_4@O22-H22 BMS_89@O22-BMR_4@O26-H26 BMS_89@O12-BMR_4@O12-H12 BMR_15@O25-BMR_15@O26-H26 BMS_96@O25-BMR_5@O16-H16 BMR_13@O23-BMR_6@O26-H26 BMR_27@O22-BMR_126@O12-H12 BMR_17@O26-BMR_6@O13-H13 BMR_26@O26-BMR_6@O16-H16 BMR_29@O26-BMR_7@O16-H16 BMS_86@O23-BMR_19@O26-H26 BMS_78@O16-BMR_9@O16-H16 BMS_96@O24-BMR_10@O23-H23 BMR_14@O25-BMR_11@O24-H24 BMS_90@O22-BMR_11@O26-H26 BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12 BMR_120@O24-BMR_11@O13-H13 BMR_25@O22-BMR_11@O13-H13 BMS_65@O24-BMR_12@O23-H23 BMR_31@O11-BMR_12@O12-H12
我想 select 基于某些条件的列。 如果使用如下命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile
我得到类似的东西:
BMR_1@O13-BMR_14@O13-H13
BMR_2@O13-BMR_16@O13-H13
BMR_6@O13-BMR_27@O23-H23
BMR_2@O13-BMR_16@O12-H12
BMR_1@O13-BMR_30@O26-H26
BMR_1@O13-BMR_11@O23-H23
BMR_1@O13-BMR_14@O22-H22
BMR_6@O13-BMR_27@O22-H22
如果我使用如下命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9][1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile
我得到如下输出:
BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12
BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12
BMR_17@O13-BMR_27@O13-H13
BMR_64@O13-BMR_39@O12-H12
BMR_58@O13-BMR_44@O16-H16
BMR_36@O13-BMR_61@O12-H12
BMR_36@O13-BMR_61@O13-H13
如果我想同时 select 单位数和双位数(比如 BMR_2@O13-BMR_16@O12 -H12 和 BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12) 在一个 运行 ?
您可以在单个 awk 命令中将重复指定为 1 次或 2 次,如下所示:
awk --posix 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]{1,2}@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile