RStudio: Error in .jarray(m) : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space

Question

为了能够运行包 extraTrees（我需要制作极端随机树），我需要在我的 RStudio 中安装 Rjava 包。当我在有限数量的数据（1000 个观测值）中使用下面的代码时，它可以完美地工作。但是我需要能够运行 50 000-100 000 个观测值的数据集上的代码，并对其进行迭代50次...

library(rJava)
library(extraTrees)

et <- extraTrees(Input, Output, ntree = 300 ,nodesize=3, numRandomCuts=2, numThreads= 4)

当我尝试运行时，出现以下错误：

 Error in .jarray(m) : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space

有人知道怎么解决吗？我一直在寻找答案，但没有找到如何将其放入 RStudio 环境中的方法。

Answer 1

Xmx 标志控制 Java 运行时间堆的大小。您可以将其增加到更大的值，这可能会让您的 R 代码达到运行而不会达到上限：

> options(java.parameters = "-Xmx4g")     # or 8g, or larger than this, ...

请注意，这只会为您的 R 脚本调用的 Java 进程增加堆。在 R 之外，您的 Java 使用的堆大小应该保持不变。如果你愿意，你也可以在外部更改它。

我知道 Xmx 但不知道如何在 R 控制台中执行此操作。为此，我发现了这个有用的博客 post:

Answer 2

就我而言，我可以使用以下方法解决该问题：

options(java.parameters = "-Xmx1024m")

在加载任何包或库之前。

Example:
> options(java.parameters = "-Xmx1024m")
> library(RJDBC)

java