使用 python3-config 的 Pybind11 编译不工作

Question

我想使用 Pybind11 将一个简单的 C++ 函数集成到 Python 中。考虑以下虚拟函数的简单示例：

#include <vector>
#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/stl.h>

namespace py = pybind11;

// Dummy function: return a vector of size n, filled with 1
std::vector<int> generate_vector(unsigned int n)
{
    std::vector<int> dummy_vector;
    for(int i = 0; i < n; i++) dummy_vector.push_back(1);
    return dummy_vector;
}

// Generate the python bindings for this C++ function
PYBIND11_PLUGIN(example) {
    py::module m("example", "Generate vector of size n");
    m.def("generate_vector", &generate_vector, "Function generates a vector of size n.");
    return m.ptr();
}

我将此代码存储在一个名为 example.cpp 的函数中我在 Anaconda 中使用 Python 3.5.2。在 official documentation 之后，我编译的脚本如下：

c++ -O3 -shared -std=c++11 -I /Users/SECSCL/anaconda3/include/python3.5m `python-config --cflags --ldflags` example.cpp -o example.so

我不确切知道 'python-config' 部分代表什么，但我知道它会导致问题。我尝试了三种选择：

python-config：这会导致 clang 错误，链接器命令失败
python3-config：与 python-config
python3.4-config：这实际上有效并创建了一个 example.so 文件。但是当我尝试从 python3.5 加载它时，出现错误

致命 Python 错误：PyThreadState_Get: 没有当前线程

总而言之，我的问题是：如何编译我的代码以便我可以从 python3.5 加载它？或者更准确地说：我必须用什么来替换 'python-config' 语句？

Answer 1

我能够在我的 macOS Sierra 2015 年初 MacBook Pro 上运行您的示例。

我使用了您的 example.cxx 代码，没有任何更改。

在编译模块之前，您必须确保 anaconda 环境处于活动状态，以便编译命令调用正确的 python-config 命令。

在我的例子中，这是通过以下方式完成的：source ~/miniconda3/bin/activate——您显然必须将 miniconda3 替换为 anaconda3。

现在 double-check 您的编译命令将调用正确的 python-config 通过执行以下操作： which python3.5-config -- 这应该会告诉您它正在使用您的 anaconda3 python3.5-config。

现在可以调用编译如下：

c++ -O3 -shared -std=c++11 -I $HOME/build/pybind11/include \
-I $HOME/miniconda3/include/python3.5m \
`python3.5m-config --cflags --libs` -L $HOME/miniconda3/lib/ \
 example.cpp -o example.so

请注意，我必须将包含路径添加到我的 pybind11 结帐，指定确切的 python-config 版本 (3.5m)，将 --ldflags 更改为 --libs 以便 python-config 不会添加会导致错误的 --stack-size link 参数，最后我为包含 libpython3.5m.dylib

在此之后，我可以做：

$ python
Python 3.5.2 |Continuum Analytics, Inc.| (default, Jul  2 2016, 17:52:12)
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 4.2 (clang-425.0.28)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import example
>>> v = example.generate_vector(64)
>>> print(v)
[1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1]

...非常整洁！

使用 python3-config 的 Pybind11 编译不工作

Pybind11 compilation with python3-config not working

c++

python-3.x

pybind11