无法在数据实验室笔记本中安装底图包

Question

我正在尝试运行 Google 需要底图的数据实验室 Jupyter 笔记本中的脚本，但我无法安装此包。 Yelsayed 指出该模块需要多个依赖项，但即使构建了这些依赖项，该模块也不会安装。

以下是我认为需要安装的依赖项：

!pip install Cython

!apt-get update && apt-get install -y gcc

!pip install pyproj

!pip install GEOS

这些安装没有事件。最后 Yelsayed 再次指出的底图本身需要完成以下操作：

!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

这需要时间来安装并且看起来很有希望，但最终安装到 99% 然后输出 "killed":

Collecting https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz
Downloading https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz (129.7MB)
99% |############################### | 129.7MB 154kB/s eta 0:00:01Killed

最后的 "Killed" 似乎表明它最终没有奏效。它可靠地执行此操作，以相同的方式重新尝试上述调用失败。无论如何，我尝试导入模块，但仍然出现相同的错误：

ImportError: No module named basemap

为什么会发生这种情况，您如何在此环境中成功安装底图？

Answer 1

由于大小原因，basemap 似乎没有托管在 PyPI 上。查看 https://github.com/matplotlib/basemap.

上的安装说明

您可以直接使用他们的 link for v1.0.7:

!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

编辑

这里还有一些安装先决条件的详细信息，运行笔记本单元中的以下所有内容：

地理位置：

最好的办法是直接从 apt 安装它以避免版本控制问题。你可以这样做：

%bash
apt-get update && apt-get install -y build-essential libgeos-3.4.2 libgeos-c1 libgeos++-dev

pyproj, pyshp

然后安装 python 依赖项，使用 pip 很容易：

%bash
pip install pyproj pyshp

底图

然后就可以使用上面的link安装底图包了：

%bash
!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

然后您可以导入底图class:

from mpl_toolkits.basemap import Basemap

Answer 2

您可以在 Google Cloud Datalab Notebook

中编写这段代码来解决问题

! apt-get -y --allow-unauthenticated --fix-missing install python-mpltoolkits.basemap python-numpy python-matplotlib

Answer 3

Basemap 不随 google 数据实验室一起提供。

截至 2019 年 2 月，这适用于新的 google 数据实验室：

第 1 步：安装先决条件

!apt-get update && apt-get install -y --allow-unauthenticated build-essential libgeos-3.5.0 libgeos-c1v5 libgeos++-dev

注意：我尝试了 yelsayed 的示例，但是我的数据实验室找不到 libgeos-3.4.2，而 libgeos-c1 在我运行时已被弃用。我将这些值更新为 3.5.0 和 c1v5 并且它起作用了。我还必须添加允许未经身份验证的标签部分。

!pip install pyproj pyshp

第 2 步：安装整个包

!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

第三步：检查包是否安装正确

!pip freeze

第 4 步：导入模块

from mpl_toolkits.basemap import Basemap

无法在数据实验室笔记本中安装底图包

Can't install basemap package in datalab notebook

python

google-cloud-datalab

jupyter-notebook

地理位置：

pyproj, pyshp

底图