R中的分类变量子集

Question

我如何根据“湖泊”对我的数据进行子集化，然后在同一地块上绘制所有三个湖泊的养分（P、N、C）与日期的关系图。另一件事是我的数据中有空白 (NA)，我不想用零替换它。因为它会表明化学物质的浓度为零，这是不正确的。有什么方法可以让 R 不为 NA 值绘制任何点？看起来我在 R 中用 NA 值得到了奇怪的图。但是 excel 没有那个问题。（excel 根本不为空白绘制任何东西）

lake                     date    depth        P          N           C
East Long Lake       9/5/1994     0.7      21.9      254.8
East Long Lake       9/5/1994     1.0      30.1     1190.0       257.0
East Long Lake       9/5/1994     1.5      20.5      256.6
East Long Lake       9/5/1994     2.5      22.1      249.0
East Long Lake       9/5/1994    12.0     212.5     2011.6      1090.6
Central Long Lake   6/30/1995     0.6      22.9       91.1
Central Long Lake   6/30/1995     4.0
Peter Lake           7/6/1994     6.1      41.9      527.2        29.6
Peter Lake           7/6/1994    12.0     138.8     1994.0      1409.6
Peter Lake          7/13/1994     0.0      19.1      746.7        22.6 
Peter Lake          7/13/1994     0.7      19.2      21.3

Answer 1

我想这就是您要找的。

library(data.table)
library(ggplot2)
dt = fread("tmp.csv")
dt$date = as.Date(dt$date, "%m/%d/%Y")
dt[,"depth" := NULL]
d <- melt(dt, id.vars=c("lake","date"))

ggplot(d=subset(d, !is.na(value)), aes(date, value, col = variable)) + geom_point() + facet_wrap(~ lake)

这可能是您正在寻找的图表：

ggplot(d=subset(d, !is.na(value)), aes(date, value, col = lake)) + geom_point() + facet_wrap(~ variable)

R中的分类变量子集

Categorical Variable subsetting in R

plot

r

rstudio