scipy中联动函数的输入应该是什么？
What should be the input of the linkage function in scipy?
我使用Bindiff计算了恶意软件文件之间的相似度，据此构建了一个基于两两相似度比较的相似度矩阵。我想使用 scipy.cluster.hierarchy.linkage(y, method='single', metric='euclidean') 对结果进行聚类，但文档说 y 应该是一个压缩或冗余距离矩阵。
那么，如何将相似度矩阵（不是距离矩阵）转换为所需的格式？
在 this thread 中提到的 y 可以是距离矩阵的上三角。但我想指出 Bindiff 中的比较顺序会改变结果，因此 similarity(file1,file2) != similarity(file2,file1)
那么我该如何解决这个问题呢？
您可以自己实现层次聚类！
有tutorials for implementing it个。您需要做的就是使用相似度而不是距离。
但是您很快就会意识到，您需要使其成为对称相似性，两个距离的最小值、平均值、最大值，等等。
我使用Bindiff计算了恶意软件文件之间的相似度，据此构建了一个基于两两相似度比较的相似度矩阵。我想使用 scipy.cluster.hierarchy.linkage(y, method='single', metric='euclidean') 对结果进行聚类，但文档说 y 应该是一个压缩或冗余距离矩阵。
那么，如何将相似度矩阵（不是距离矩阵）转换为所需的格式？
在 this thread 中提到的 y 可以是距离矩阵的上三角。但我想指出 Bindiff 中的比较顺序会改变结果，因此 similarity(file1,file2) != similarity(file2,file1)
那么我该如何解决这个问题呢？
您可以自己实现层次聚类！
有tutorials for implementing it个。您需要做的就是使用相似度而不是距离。
但是您很快就会意识到，您需要使其成为对称相似性，两个距离的最小值、平均值、最大值，等等。