BizTalk 中的 FHIR JSON 到 XML 解码

FHIR JSON to XML decoding in BizTalk

我刚开始使用 FHIR 和 json,所以我的问题可能不太好问。

我已经构建了一个 BizTalk 管道组件以使用此库将 FHIR-json 转换为 FHIR-xml,https://github.com/ewoutkramer/fhir-net-api , based on an example i found here, http://soapfault.com/blog/2016/08/hl7-fhir-json-decoding-in-biztalk/

这是管道组件的代码片段。它与示例几乎相同。

//Read the json message
                        using (TextReader tr = new StreamReader(originalDataStream))
                        {
                            json = tr.ReadToEnd();
                        }

                        //Use FHIR-NET-API to create a FHIR resource from the json
                        Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader resourceReader = new Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(FhirJsonParser.CreateFhirReader(json), ParserSettings.Default);

                        //Use FHIR-NET-API to serialize the resource to XML
                        byte[] resourceXmlBytes = Hl7.Fhir.Serialization.FhirSerializer.SerializeToXmlBytes(resourceReader.Deserialize());

管道组件能够解码以 json 开头的任何单个 FHIR 消息 { "resourceType": "ImagingStudy",

但是我收到这样开头的消息的解析错误,

{
  "resourceType" : "Bundle",
  "entry" : [{
      "resource" : {
        "resourceType" : "ImagingStudy",

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl":     "http://fhirtest.uhn.ca/baseDstu2/ImagingStudy/EXexample",
      "resource": {
        "resourceType": "ImagingStudy",

这是我遇到的一些错误,

There was a failure executing the receive pipeline: "LALALA.Imaging.Pipelines.FHIRJasonDecoderRP, LALALA.Imaging.Pipelines, Version=1.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=19bb8b5ea64396aa" Source: "FHIRJsonDecoder" Receive Port: "RP_LA_Test_FILE" URI: "D:\Projects\LALALA.Imaging\In\*.json" Reason: Data at the root level is invalid. Line 1, position 1.

Reason: At line 1, pos 1: Cannot determine type of resource to create from json input data: no member resourceType was found

对于我的解决方案,最终目标是能够将 FHIR 图像研究消息束解析为单个 fhir xml 消息,然后将其映射到 HL7 ORU 消息。

对于上述问题的任何帮助或关于如何使用 BizTalk 实现我的最终目标的建议将不胜感激。

通常不需要直接调用 ResourceReader,不过我尝试重现您的错误,如下所示:

var json = @"{
            ""resourceType"" : ""Bundle"",
            ""entry"" : [{
                  ""resource"" : {
                       ""resourceType"" : ""ImagingStudy""
                                       }}]}";

// SHORT VERSION: var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(json);
var b = new     
             Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(
               FhirJsonParser.CreateFhirReader(json),  
                          ParserSettings.Default).Deserialize();

Assert.IsNotNull(b);

但是,两者都可以正常工作。阅读流时可能出现问题?

您也可以尝试直接从流中读取:

var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(new 
                     Newtonsoft.Json.JsonTextReader(stream));