pysam 模块导入导致错误

Question

正在努力定义导致此错误的原因。

已经安装了 anaconda 并使用了 conda install pysam，工作了一段时间但突然出现此错误

>>> import pysam
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/Users/Nick/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/__init__.py", line 125, in <module>
    [ "SamtoolsError", "SamtoolsDispatcher" ] + list(SAMTOOLS_DISPATCH) +\
AttributeError: 'module' object has no attribute '__all__'

查看了文件里面对应的代码是

# hack to export all the symbols from csamtools
__all__ = \
    csamtools.__all__ + \
    ctabix.__all__ + \
    cvcf.__all__ +\
    [ "SamtoolsError", "SamtoolsDispatcher" ] + list(SAMTOOLS_DISPATCH) +\
    ["Pileup" ]

知道是什么原因造成的吗？？？

Answer 1

好的，用conda卸载了，也用pip卸载了，然后pip重装好像解决了。

模块的其他部分仍然出现一些错误，但正在修复。

多谢指教！

pysam 模块导入导致错误

pysam module import results in error

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