空间测地线位置聚类 - ggplot2错误

Question

我正在使用 @jlhoward 之前在 Approaches for spatial geodesic latitude longitude clustering in R with geodesic or great circle distances

发布的代码

但是，我正在尝试为瑞典实施同样的事情。当我加载 shp 文件时，我从 ggplots 得到一个错误。我该如何解决这个问题？我的代码如下：

map.SE  <- readOGR(dsn="sweden-latest", layer="places")
map.df  <- fortify(map.SE)

ggplot(map.df)+
  geom_path(aes(x=long, y=lat, group=group))+
  geom_point(data=df, aes(x=long, y=lat, color=factor(clust)), size=4)+
  scale_color_discrete("Cluster")+
  coord_fixed()

我得到的错误是在 "fortify" 步骤 - ggplot2 doesn't know how to deal with data of class SpatialPointsDataFrame

Answer 1

问题是您的 shapefile 是点数据，而不是链接示例中的多边形（使用多边形作为轮廓）。 fortify() 在此上下文中用于将多边形转换为一系列顶点以在 ggplot2 中绘制，因此永远不适用于点数据。

如果您想复制他们的结果，您需要一个瑞典的多边形 shapefile 来代替示例中使用的加利福尼亚的 shapefile。

Answer 2

获取 GIS 形状文件的一种简单方法是使用 raster 包。您可以下载 GADM 数据。然后，您可以在以后进行各种 ggplot 业务。如您所愿，您可以使用 geom_point() 添加点，例如

library(raster)
library(ggplot2)

sweden <- getData("GADM", country = "Sweden", level = 1)
map <- fortify(sweden)

ggplot() + 
geom_map(data = map, map = map, aes(x = long, y = lat, map_id = id, group = group)) +
coord_map()

空间测地线位置聚类 - ggplot2错误

spatial geodesic location clustering - ggplot2 error

r

cluster-analysis

ggplot2