提取字符并重命名 R 中的列

Extract characters and rename columns in R

我是 R 新手。我从数据库导出数据并尝试重命名列。

现有名称示例(每个水质参数一个站点)在下面的引号中。每个站点有6个可能的参数,共40个站点​​;我想根据参数和站点重命名列。站点名称为 3-7 个字符,并且始终出现在最后一个小数点之后。我的数据集 (AQexport1) 有 240 列和 47,714 行(行是每小时连续数据的时间戳)。我希望能够将代码用于此数据库中具有相同格式和参数但可能不同站点的其他导出。

例如:

  1. "Water.Temp.Water.Temp.BUBU" | "Water.Temp.Temperature.BUBU" <--- Temp.BUBU
  2. "Water.Temp.Field.Visits.KNF_DUP" <--- FVTemp.KNF_DUP
  3. "Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.LOD_DUP" <---SpCnd.LOD_Dup
  4. "Sp.Cond.TempCorrected.PFM" <--- SpC.PFM
  5. "Sp.Cond.Field.Visits.CC7" <-- FVSpC.CC7
  6. "Cond.Conductivity.TM02Dup"<-- Cond.TM02Dup

我不知道如何在 if 语句中编写 contains()(我意识到下面的语法是错误的,我只是想展示我的想法),或者如何从中提取字符具有多个小数点并且不会从列名末尾提取相同数量的字符的字符串。我也想知道通过 colnames() 的 for 循环是否是最好的解决方案。

for (i in 1:colnames(AQexport1)){
  if (colnames(AQexport1[i]) contains "Water.Temp.W" | "Water.Temp.T"){
    colnames(AQexport1[i]) <- Temp.insert_site_name_here
  } 
    elseif (colnames(AQexport1[i])) contains "Water.Temp.F") {
      colnames(AQexport1[i]) <- FVTemp.insert_site_name_here
    }
    elseif (colnames(AQexport1[i])) contains "nodrift") {
      colnames(AQexport1[i])<-SpCnd.insert_site_name_here
    }
    elseif (colnames((AQexport1[i])) contains "Sp.Cond.T") {
      colnames(AQexport1[i])<-SpC.insert_site_name_here
    }
#continue elseif statements
} 

作为一个简化的案例,这就是您根据名称是否包含字母 'a' 或 'b',或包含 'c' 或 'd' 等来重新分配名称的方式等等。

dat <- data.frame(aa = runif(10), ba = runif(10), ct = runif(10), df = runif(10), en = runif(10), zz = runif(10))

names(dat)
##  "aa" "ba" "ct" "df" "en" "zz"

library(magrittr)

# logical, TRUE if names contain a or b
condition1 <- sapply(c('a','b'), grepl, names(dat)) %>% rowSums %>% as.logical

# logical, TRUE if names contain c or d
condition2 <- sapply(c('c','d'), grepl, names(dat)) %>% rowSums %>% as.logical

# logical, TRUE if names contain e
condition3 <- grepl('e', names(dat))



names(dat) <- ifelse(condition1, 'newname1',
              ifelse(condition2, 'newname2',
              ifelse(condition3, 'newname3', 
                                 'newname4')))

names(dat)
## [1] "newname1" "newname1" "newname2" "newname2" "newname3" "newname4"

AQexport 1 是我的数据集,需要新的列名。这是我的解决方案。

# 6 parameters with 11 syntax's to change column names for (each syntax could have up to 40 variations (.site names):
# "Water.Temp.Water.Temp.BUBU" or 
# "Water.Temp.Temperature.BUBU" or
# "Water.Temp.Temp.BUBU"<--- Temp.BUBU
# "Water.Temp.Field.Visits.KNF_DUP" <--- FVTemp.KNF_DUP
# "Sp.Cond.Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.DRBR" or 
# "Sp.Cond.Sp.Cond..TempCorrected_nodrift.BRCD" or 
# "Sp.Cond.SpCond.nodrift.TM01" or
# "Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.LOD_DUP" <---SpCnd.site
# "Sp.Cond.TempCorrected.PFM" <--- SpC.PFM
# "Sp.Cond.Field.Visits.CC7" <-- FVSpC.CC7
# "Cond.Conductivity.TM02Dup"<-- Cond.TM02Dup
# nchar("Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.DRBR") #number of characters in string

#logical vectors, TRUE if AQexport1 column names match charcter input in grepl
Names<-names(AQexport1)
Temp.siteW<-grepl("Water.Temp.Water.Temp", Names)
Temp.siteT<-grepl("Water.Temp.Temperature", Names)
Temp.siteTT<-grepl("Water.Temp.Temp", Names)
FVTemp.site<-grepl("Temp.Field", Names)
FVSpC.site<-grepl("Sp.Cond.Field", Names)
SpCnd.site1<-grepl("Sp.Cond.Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.", Names)
SpCnd.site2<-grepl("Sp.Cond.Sp.Cond..TempCorrected_nodrift..", Names)
SpCnd.site3<-grepl("Sp.Cond.SpCond.nodrift.", Names)
SpCnd.site4<-grepl("Sp.Cond.TempCorrected_nodrift.", Names)
Cond.site<-grepl("Cond.C", Names)
SpC.site<-grepl("Sp.Cond.TempCorrected.", Names) #Sp.Cond.TempCorrected.  the last period is critical to distinguish from nodrift

#Creating new column name: Paste parameter prefix to site name (extracted  from old column name with substring)
#Making parameter always 4 characters
Temp.namesW<-paste("Temp.",substring(Names,23), sep="")
Temp.namesT<-paste("Temp.",substring(Names,24), sep="")
Temp.namesTT<-paste("Temp.",substring(Names,17), sep="")
FVTemp.names<-paste("FTem.",substring(Names,25), sep="")
FVSpC.names<-paste("FSpC.",substring(Names,22), sep="")
SpCnd.names1<-paste("SCnd.",substring(Names,39), sep="")
SpCnd.names2<-paste("SCnd.",substring(Names,40), sep="")
SpCnd.names3<-paste("SCnd.",substring(Names,24), sep="")
SpCnd.names4<-paste("SCnd.",substring(Names,31), sep="")
Cond.names<-paste("Cond.",substring(Names,19), sep="")
SpC.names<-paste("SpCc.",substring(Names,23), sep="")

for (i in 1:ncol(AQexport1)){
  if(Temp.siteW[i]){
    names(AQexport1)[i]<-Temp.namesW[i]
  }
  else if(Temp.siteT[i]){
  names(AQexport1)[i]<-Temp.namesT[i]
  }
  else if(Temp.siteTT[i]){
    names(AQexport1)[i]<-Temp.namesTT[i]
  }
  else if(FVTemp.site[i]){
  names(AQexport1)[i]<-FVTemp.names[i]
  }
  else if(FVSpC.site[i]){
    names(AQexport1)[i]<-FVSpC.names[i]
  }
  else if(SpCnd.site1[i]){
    names(AQexport1)[i]<-SpCnd.names1[i]
  }
  else if(SpCnd.site2[i]){
    names(AQexport1)[i]<-SpCnd.names2[i]
  }
  else if(SpCnd.site3[i]){
    names(AQexport1)[i]<-SpCnd.names3[i]
  }
  else if(SpCnd.site4[i]){
    names(AQexport1)[i]<-SpCnd.names4[i]
  }
  else if(Cond.site[i]){
    names(AQexport1)[i]<-Cond.names[i]
  }
  else if(SpC.site[i]){
    names(AQexport1)[i]<-SpC.names[i]
  }
}