Python DEAP，X代后适应度没有增加，如何停止进化？

Question

我想在适应度没有增加的时候停止遗传算法。

我在 python 中使用 DEAP 库。

通常，我有以下日志文件：

    gen nevals  mean        max     
    0   100 0.352431    0.578592
    1   83  -0.533964   0.719633
    2   82  -0.567494   0.719633
    3   81  -0.396759   0.751318
    4   74  -0.340427   0.87888
    5   80  -0.29756    0.888443
    6   86  -0.509486   0.907789
    7   85  -0.335586   1.06199
    8   69  -0.23967    1.12339
    9   73  -0.10727    1.20622
    10  88  -0.181696   1.20622
    11  77  -0.188449   1.20622
    12  72  0.135398    1.25254
    13  67  0.0304611   1.26931
    14  74  -0.0436463  1.3181
    15  70  0.289306    1.37582
    16  79  -0.0441134  1.37151
    17  73  0.339611    1.37204
    18  68  -0.137938   1.37204
    19  76  0.000527522 1.40034
    20  84  0.198005    1.40078
    21  69  0.243705    1.4306
    22  74  0.11812 1.4306
    23  83  0.16235 1.4306
    24  82  0.270455    1.43492
    25  76  -0.200259   1.43492
    26  77  0.157181    1.43492
    27  74  0.210868    1.43492

我最初设置 ngen = 200，但正如您所见，适应度函数在第 22 代达到了局部最大值。所以我想在这种情况下停止遗传算法。

Answer 1

def main():
    random.seed(64)
    pop = toolbox.population(n=100)
    CXPB, MUTPB = 0.5, 0.2
    print "Start of evolution"
    fitnesses = list(map(toolbox.evaluate, pop))
    for ind, fit in zip(pop, fitnesses):
        ind.fitness.values = fit
    print "  Evaluated %i individuals" % len(pop)
    fits = [ind.fitness.values[0] for ind in pop]
    g = 0
    while max(fits) < 0.67 and g < 1000000:
        g = g + 1
        print "-- Generation %i --" % g
        offspring = toolbox.select(pop, len(pop))
        offspring = list(map(toolbox.clone, offspring))
        for child1, child2 in zip(offspring[::2], offspring[1::2]):
            if random.random() < CXPB:
                toolbox.mate(child1, child2)
                del child1.fitness.values
                del child2.fitness.values
        for mutant in offspring:
            if random.random() < MUTPB:
                toolbox.mutate(mutant)
                del mutant.fitness.values
        invalid_ind = [ind for ind in offspring if not ind.fitness.valid]
        fitnesses = map(toolbox.evaluate, invalid_ind)
        for ind, fit in zip(invalid_ind, fitnesses):
            ind.fitness.values = fit
        pop[:] = offspring
        fits = [ind.fitness.values[0] for ind in pop]
        print "fitness-- ",max(fits)
    print "-- End of (successful) evolution --"
    best_ind = tools.selBest(pop, 1)[0]
    triangle_to_image(best_ind).save('best.jpg')

这将在达到所需的适应度值时停止代码或超过特定的世代数

你可以设置它在适应度一段时间内没有改变时停止，即当它达到局部最大值并卡在那里时

第 12 行 此示例在适应度超过 0.67 时停止 然后保存结果

当你不使用名人堂之类的东西时，这是这样做的方法 不知道怎么做，如果你找到了也告诉我

Answer 2

老实说，我最近也在研究这个问题。根据我最近所做的研究，我发现了以下内容：

有一个实现 CMA-ES 算法的 DEAP 示例。它包含停止标准 ()
有一篇论文值得一读：https://heal.heuristiclab.com/system/files/diss%20gkr2.pdf
上述解决方案实现了 Issue 中提到的内容：https://github.com/DEAP/deap/issues/271

我还没有尝试 none 以上方法，但我非常确定它会起作用。

Python DEAP，X代后适应度没有增加，如何停止进化？

Python DEAP, how to stop the evolution when the fitness doesn't increase after X generations?

python

genetic-algorithm

deap